结论：

1. 一般情况下，被委托方不能直接以自身名义申报委托方单位的佣金，但存在例外情形。
   
2. 若符合特定条件（如税务机关允许、合同明确约定等），被委托方可能被授权代为办理申报手续，但申报主体仍为委托方单位。
   

具体分析：

1. 税务申报的主体资格问题

根据《中华人民共和国税收征收管理法》及其实施细则，纳税申报的主体应为实际承担纳税义务的单位或个人。在委托代理发放佣金的场景中：

• 委托方单位是佣金的支付方，通常也是个人所得税的扣缴义务人（如涉及劳务报酬所得），或企业所得税的纳税主体（如佣金计入成本费用）。
  
• 被委托方仅是代理发放款项的中介，若未实际取得佣金收入或未产生纳税义务，则无权以自身名义申报。
  

例外情形：若被委托方实际承担了纳税义务（如被委托方是佣金的最终支付方，或合同明确约定由被委托方代扣代缴税款），则可能需以自身名义申报，但需满足以下条件：

• 税务机关明确允许或认可；
  
• 委托方与被委托方签订书面协议，明确税款承担及申报责任；
  
• 被委托方具备代扣代缴资质（如取得税务机关授权）。
  

2. 合同约定与实际操作的风险

• 合同约定优先：若委托方与被委托方在合同中明确约定由被委托方代为办理纳税申报，且符合税务机关要求，则被委托方可代为操作，但申报时需注明委托方信息，避免主体混淆。
  
• 风险点：若被委托方未经授权擅自以自身名义申报，可能导致：
  
  • 委托方被税务机关追责（如未履行扣缴义务）；
    
  • 被委托方被认定为“虚假申报”，面临罚款或法律责任。
    

3. 实务建议

1. 明确合同条款：在委托协议中清晰约定税款承担方、申报主体及操作流程，必要时咨询税务机关意见。
   
2. 保留书面证据：如委托方授权被委托方代为申报的书面文件、税务机关的批复等，以备查验。
   
3. 合规操作：被委托方代为申报时，需在税务系统中准确填写委托方信息，避免混淆纳税主体。
   

总结：被委托方能否申报佣金，需结合税法规定、合同约定及税务机关要求综合判断。建议双方在操作前充分沟通，确保合规性。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的法律风险。