船舶停运损失在符合一定条件下，是可以申请行政赔偿的。以下从法律基础、赔偿范围、实际操作与注意事项等角度进行详细分析：
一、法律基础与依据
《中华人民共和国国家赔偿法》第四条：
- 该条款明确规定了行政机关及其工作人员在行使行政职权时，若违法实施罚款、吊销许可证和执照、责令停产停业、没收财物等行政处罚，或违法对财产采取查封、扣押、冻结等行政强制措施，以及违法征收、征用财产，造成财产权损害的，受害人有取得赔偿的权利。船舶停运损失若因行政机关的违法行政行为导致，受害人有权依据此条款申请行政赔偿。
《中华人民共和国国家赔偿法》第三十六条：
- 该条款进一步细化了赔偿的处理方式，特别是针对停产停业期间必要的经常性费用开支（如职工基本工资、水电费、设备维护费等），应予以赔偿。对于船舶停运损失，若属于停产停业期间必要的经常性费用开支，或能够证明与违法行政行为有直接因果关系的间接损失，也可能纳入赔偿范围。
二、赔偿范围与标准
直接损失：
- 船舶停运期间的直接损失，如船员工资、燃油费、港口费用等，通常会被纳入赔偿范围。这些损失是船舶因停运而直接产生的费用，与违法行政行为有直接的因果关系。
间接损失：
- 对于间接损失，如预期利益等，通常仅赔偿直接损失。但在特殊情况下，如有法律明确规定或有充分证据证明与违法行政行为有直接因果关系，也可能纳入赔偿范围。例如，若因行政机关的违法查封导致船舶长期无法运营，且能够证明因此失去了特定的运输合同或业务机会，这部分预期利益损失也可能得到赔偿。
赔偿标准：
- 赔偿的标准通常按照船舶实际损失进行赔偿，具体计算方法可能涉及损失发生时的市场价格或其他合理方式。在实际操作中，需要提供充分的证据来证明停运损失的具体数额，如船舶运营记录、收入证明、费用支出凭证等。
三、实际操作与注意事项
证据收集与保存：
- 在申请行政赔偿时，受害人应尽可能收集并保存所有与停运损失相关的证据。这些证据将有助于证明停运损失的存在和具体数额，提高赔偿申请的成功率。
区分行政赔偿与民事赔偿：
- 需要注意的是，船舶停运损失可能同时涉及行政赔偿和民事赔偿。例如，若船舶停运是由于交通事故等民事侵权行为导致，受害人可以依法向侵权人主张赔偿。但在此情况下，保险公司通常不赔付车辆停运损失费用，这部分费用通常由交通事故责任者承担。这与行政赔偿的情境有所不同，需加以区分。
遵循法定程序：
- 申请行政赔偿需要遵循法定的程序和要求。受害人应向赔偿义务机关提出赔偿申请，并提供相关证据材料。赔偿义务机关在收到申请后，会进行审查并作出赔偿决定。若受害人对赔偿决定不服，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。
总结与建议：
船舶停运损失在符合一定条件下是可以申请行政赔偿的。受害人在申请赔偿时，应充分了解相关法律法规和司法解释的规定，准备充分的证据材料，并按照规定的程序和要求进行申请。同时，也应注意区分行政赔偿与民事赔偿的不同情境和规定，确保自己的权益得到充分保障。若你在实际操作中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。