停运损失会按照责任赔偿。具体分析如下：

一. 停运损失赔偿的责任原则

• 停运损失，作为因交通事故导致的间接损失，其赔偿应遵循责任原则。即，赔偿义务人应根据其在交通事故中所负的责任比例，对受害人的停运损失进行相应的赔偿。

二. 法律依据

• 虽然《中华人民共和国民法典》及《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》中未直接规定停运损失必须按责任赔偿，但根据民法的一般原则，损害赔偿责任应与侵权行为人的过错程度相适应，即“责任相适”原则。因此，停运损失的赔偿也应遵循这一原则。

三. 实际操作

• 在实际处理中，停运损失的赔偿通常会考虑事故责任比例。例如，如果事故责任完全在对方，那么对方的保险公司或责任人应全额赔偿停运损失；如果双方都有责任，那么赔偿金额将按照各自的责任比例进行分摊。

四. 注意事项

• 在主张停运损失赔偿时，受害人需要提供充分的证据来证明其停运损失的存在和具体金额，如营运车辆的营运记录、收入证明等。
• 同时，也应注意与保险公司或责任人进行协商，以达成合理的赔偿协议。如果协商不成，可以通过法律途径维护自己的合法权益。

我建议，在遭遇停运损失时，首先应明确事故责任比例，然后根据相关证据和法律规定，向责任方或保险公司主张相应的赔偿。如有进一步需要，您可以继续咨询我。