交通肇事案件是否由检察院起诉，主要取决于交通肇事行为是否构成交通肇事罪。若构成犯罪，则由检察院代表国家提起公诉；若不构成犯罪，则一般按民事侵权纠纷处理。以下是对这一问题的详细分析：

一、构成交通肇事罪的情况

1. 行为主体存在违法违规的交通运输行为：

   • 即违反交通运输管理法规，如超速行驶、闯红灯、酒驾、毒驾等，并因此引发交通事故。

2. 行为主体对事故负主要或全部责任：

   • 根据事故现场勘查、证人证言、监控录像等证据，确定肇事者对事故的发生负有主要或全部责任。

3. 事故造成人员伤亡或重大财产损失：

   • 具体标准包括死亡一人或者重伤三人以上，且肇事者负事故全部或者主要责任；死亡三人以上，且肇事者负事故同等责任；造成公共财产或者他人财产直接损失，且肇事者负事故全部或者主要责任，无能力赔偿数额在三十万元以上等。

若交通肇事行为满足上述条件，构成交通肇事罪，检察院通常会提起公诉。例如，肇事者因酒驾导致严重碰撞，造成人员伤亡，且现场证据、证人证言等充分证实其犯罪行为，这种情况下起诉的可能性极大。

二、不构成交通肇事罪的情况

若交通肇事行为情节较轻，不构成犯罪，如仅造成轻微财产损失或人员轻微伤，未达到上述犯罪标准的，则不会由检察院公诉。这种情况一般按照民事侵权纠纷处理，当事人可以自行协商解决，或者请求公安机关交通管理部门调解。若协商或调解不成，当事人可以向法院提起民事诉讼来解决赔偿等问题。

三、检察院不起诉的特殊情形

即使交通肇事行为构成犯罪，也存在检察院不起诉的特殊情形，主要包括以下几类：

1. 法定不起诉：

   • 如情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的；经特赦令免除刑罚的；犯罪嫌疑人、被告人死亡的等。

2. 酌定不起诉：

   • 如犯罪嫌疑人具有自首、立功情节；积极赔偿被害人损失并取得谅解；初犯、偶犯，且主观恶性较小等。

3. 证据不足不起诉：

   • 对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉决定。

四、建议与行动

面对交通肇事案件，无论是肇事者还是受害者，都应积极了解案件性质、法律程序及自身权益。若您或您身边的人涉及交通肇事案件，有问题可以直接向我咨询。作为专业律师，我将根据案件具体情况，为您提供全面的法律分析和建议，帮助您更好地应对法律挑战。