在行政处罚中，矿产资源评估通常由自然资源主管部门（原国土资源主管部门）负责，相关法律依据及分析如下：

1. 法律依据
   根据《中华人民共和国矿产资源法》及其实施细则，矿产资源的管理、保护与合理开发利用由自然资源主管部门统筹负责。具体到行政处罚中的评估环节，若涉及矿产资源价值认定、违法开采量核算等，通常由自然资源主管部门委托具有资质的评估机构进行，或直接依据其掌握的地质资料、开采记录等作出认定。
   例如：若企业未经许可开采矿产资源，自然资源主管部门在查处时，需评估违法开采的矿产价值以确定罚款基数，此时评估工作由自然资源主管部门主导或委托完成。

2. 部门职责划分

   • 自然资源主管部门：作为矿产资源的主管部门，负责矿产资源勘查、开采的审批与监管，以及违法行为的查处。在行政处罚中，其职责包括组织评估、认定违法事实、作出处罚决定等。
     
   • 其他部门协作：若违法行为涉及环境污染、安全生产等领域，自然资源主管部门可能联合生态环境、应急管理等部门共同调查，但矿产资源评估仍以自然资源主管部门为主。
     例如：某矿山企业因违法开采导致环境污染，自然资源主管部门负责评估矿产资源破坏价值，生态环境部门负责评估环境损害价值，两者分别作为不同违法行为的处罚依据。

3. 特殊情形说明

   • 委托评估机构：自然资源主管部门可能委托地质勘查单位、矿业权评估机构等第三方进行专业评估，但评估结果需经自然资源主管部门审核确认后方可作为处罚依据。
     
   • 地方性规定：部分省份可能通过地方性法规或规章进一步明确评估程序或部门分工，需结合具体地域政策分析。
     例如：某省《矿产资源管理条例》规定，违法开采矿产资源的价值评估由省级自然资源主管部门指定的机构承担，评估报告需经省级部门复核。

建议：若您面临矿产资源行政处罚相关问题，建议优先向当地自然资源主管部门咨询评估程序及依据，或提供具体案情（如违法行为类型、地域等），我可进一步分析处罚合法性及应对策略。