结论：当车辆已抵押给一方但被另一方法院查封时，情况会相对复杂，需根据抵押权是否设立、查封原因及时间点等多个因素来综合判断和处理。以下是从不同角度给出的详细分析和建议：
一、抵押权是否有效设立
抵押权已有效设立：
- 如果车辆抵押已经依法办理了抵押登记，那么抵押权人享有优先受偿权。即使车辆被另一方法院查封，抵押权人的权益仍受法律保护。
- 在此情况下，抵押权人可以与查封法院沟通，说明抵押情况，并请求法院在处置车辆时考虑其优先受偿权。如果法院在处置车辆时未依法保护抵押权人的权益，抵押权人可以通过法律途径维护自己的合法权益。
抵押权未有效设立：
- 如果车辆抵押未依法办理抵押登记，或者抵押合同存在无效情形（如违反法律、行政法规的强制性规定等），那么抵押权可能未有效设立。
- 在此情况下，如果车辆被另一方法院查封，抵押权人可能无法主张优先受偿权。此时，抵押权人需要评估自己的损失，并考虑通过其他法律途径（如起诉要求抵押人承担违约责任等）来维护自己的权益。
二、查封原因及时间点
查封原因：
- 法院查封车辆通常是因为车辆涉及诉讼或执行案件。如果查封是因为抵押人自身的债务问题，且与抵押权人无关，那么抵押权人可以积极与查封法院沟通，说明抵押情况，并请求法院在处置车辆时保护其优先受偿权。
- 如果查封是因为抵押权人自身的债务问题（虽然这种情况较为少见，因为抵押权人通常是债权人而非债务人），那么抵押权人需要积极应对诉讼或执行案件，并考虑如何保护自己的抵押权。
查封时间点：
- 如果车辆在抵押前已被查封，那么抵押权人可能无法就查封部分主张优先受偿权。因为在此情况下，抵押物（车辆）的权属可能已受到限制或争议。
- 如果车辆在抵押后被查封，且抵押权已有效设立，那么抵押权人可以依法主张优先受偿权。但需要注意的是，如果查封法院在处置车辆时未依法通知抵押权人或未保护其优先受偿权，抵押权人可以通过法律途径提出异议或申请复议。
三、法律建议及后续行动
核实抵押权设立情况：
- 抵押权人应首先核实车辆抵押是否已依法办理抵押登记，并确认抵押合同的有效性。如果抵押权未有效设立，抵押权人需要评估自己的损失，并考虑通过其他法律途径来维护权益。
与查封法院沟通：
- 抵押权人应积极与查封法院沟通，说明抵押情况，并请求法院在处置车辆时保护其优先受偿权。在沟通过程中，抵押权人应提供相关证据材料（如抵押合同、抵押登记证明等）以支持自己的主张。
考虑法律途径：
- 如果查封法院在处置车辆时未依法保护抵押权人的权益，抵押权人可以通过法律途径提出异议或申请复议。必要时，抵押权人还可以考虑起诉查封法院或相关当事人以维护自己的合法权益。
关注车辆处置情况：
- 抵押权人应密切关注车辆的处置情况，包括拍卖、变卖等。在车辆被处置时，抵押权人应及时主张自己的优先受偿权，并确保自己的权益得到充分保护。
后续思考依据：在处理此类案件时，抵押权人需要综合考虑多个因素，包括抵押权是否有效设立、查封原因及时间点等。同时，抵押权人还需要积极与查封法院沟通，并考虑通过法律途径来维护自己的权益。如果抵押权人对此类问题存在疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议和解决方案。