结论前置：迟到扣完工资是否合法，需视具体情况而定。若用人单位的规章制度合法有效，且扣款幅度合理，未低于当地最低工资标准，则迟到扣工资是合法的；反之，则不合法。以下从多个角度进行详细分析：
一、合法性前提：规章制度需合法有效
制定程序合法：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位在制定涉及劳动者切身利益的规章制度（如考勤制度、工资扣除规定等）时，应经过职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。这一程序确保了规章制度的民主性和合法性。
- 举例：某公司在制定考勤制度时，组织全体职工开会讨论，收集职工的意见和建议，最终与工会协商确定了迟到扣款的条款。这样的制度制定程序就是合法的。
内容合法合理：
- 规章制度中关于迟到扣钱的规定必须合理且合法。扣除的金额应与迟到造成的损失相匹配，不能畸高。例如，规定迟到一次即扣除当天甚至当月全部工资显然是不合理的，也不符合法律精神。
- 同时，扣除后的工资不得低于当地最低工资标准，以确保劳动者的基本生活需求得到保障。
公示或告知劳动者：
- 用人单位有义务将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定进行公示，或通过员工手册发放、内部培训、电子邮件等方式告知劳动者。这一步骤是确保劳动者知晓并理解规章制度的重要内容。
- 举例：公司可以将考勤制度以邮件形式发送给每一位员工，并要求员工阅读后回复确认，以确保员工已知晓相关内容。
二、扣款幅度的合理性
- 即便有了合法的规章制度，扣款数额也应合理设定。根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
- 举例：如果某劳动者当月正常出勤应发工资为3000元，当地月最低工资标准是2000元，那么因迟到扣钱导致劳动者的实际到手工资不得低于2000元，且每月扣除的部分不得超过600元（3000元的20%）。
三、违法情形及劳动者维权途径
违法情形：
- 无相关规章制度或规定不合法：如果用人单位没有制定关于迟到扣钱的规章制度，或者制定的规章制度未经过合法程序（如未经职工代表大会讨论、未与工会协商等），那么从工资中扣除迟到费用就缺乏法律依据，属于违法行为。
- 规章制度内容严重损害劳动者权益：若规章制度中规定的迟到扣钱标准过高，严重损害了劳动者的合法权益（如迟到一分钟扣100元等不合理规定），这种情况下的扣除行为也是违法的。
劳动者维权途径：
- 如果劳动者认为用人单位扣除迟到工资的行为不合法，可以通过以下途径来维护自己的合法权益：
- 与用人单位进行协商，寻求和解；
- 向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理；
- 申请劳动仲裁，通过法律程序解决争议。
四、特殊情况考虑
- 对于不可抗力因素导致的迟到，如自然灾害、交通事故等，公司一般不应扣工资。
- 对于首次迟到且情节轻微的情况，公司可以考虑给予警告、提醒等人性化处理方式，而不是直接扣款。
总结与建议：迟到扣工资并非绝对合法或非法，而是取决于用人单位的规章制度是否合法有效、扣款幅度是否合理以及是否履行了公示或告知义务。作为劳动者，应了解自己的权益和义务，在必要时采取合适的措施来维护自己的合法权益。如果您对迟到扣工资的具体情况有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。