针对员工在甲级防爆区域吸烟这一严重违反安全生产规定的行为，其处罚依据和具体措施通常依据相关法律法规以及地方性的行政处罚裁量规定来确定。以下是对此问题的详细解答：
一、法律法规依据
《中华人民共和国安全生产法》：
- 该法明确规定了生产经营单位必须执行依法制定的保障安全生产的国家标准或者行业标准，对于违反规定的行为，将依法给予行政处罚。
- 在甲级防爆区域吸烟，显然违反了安全生产的相关规定，因为这种行为极易引发火灾或爆炸事故，对人员生命安全和财产安全构成严重威胁。
《中华人民共和国消防法》：
- 该法第二十一条第一款规定，禁止在具有火灾、爆炸危险的场所吸烟、使用明火。
- 第六十三条进一步明确了违反此规定的处罚措施，包括警告、罚款以及情节严重时的拘留。
二、处罚措施
对员工个人的处罚：
- 根据《中华人民共和国消防法》第六十三条，员工在甲级防爆区域吸烟，可处警告或者五百元以下罚款；情节严重的，处五日以下拘留。
- 具体处罚力度还会根据地方性的行政处罚裁量规定以及实际违法情节的严重程度来决定。
对生产经营单位的处罚：
- 生产经营单位作为安全生产的责任主体，对于员工在甲级防爆区域吸烟的行为，也应承担相应的管理责任。
- 根据《中华人民共和国安全生产法》及相关规定，生产经营单位可能面临责令限期改正、罚款等行政处罚。罚款金额根据违法情节的严重程度和地方性裁量规定来确定，可能从数千元到数万元不等。
三、实际案例参考
- 以乌鲁木齐市某加油站经理在加油站内吸烟案为例，该经理因违反安全生产管理规定，在加油站储存间吸烟，被处以警告并罚款5500元。同时，加油站也被责令限期改正，并处以25000元罚款。
- 另一个案例是晋江市某再生资源回收站员工在回收站内吸烟，同样违反了《中华人民共和国消防法》的相关规定，被依法作出相应的行政处罚。
四、建议与警示
- 加强安全教育：生产经营单位应加强对员工的安全教育，提高员工的安全意识和法律意识，确保员工了解并遵守安全生产的相关规定。
- 完善管理制度：建立健全安全生产管理制度，明确各级人员的安全职责，加强对重点区域和关键环节的安全管理。
- 强化监督检查：定期对生产经营场所进行安全检查，及时发现并消除安全隐患，确保生产经营活动的安全进行。
综上所述，员工在甲级防爆区域吸烟是一种严重的违法行为，不仅可能面临个人处罚，还可能给生产经营单位带来严重的法律后果。因此，必须高度重视安全生产工作，严格遵守相关法律法规和规定，确保人员生命安全和财产安全。