针对退役军人违建厂房的问题，需分情况处理，核心结论如下：

1. 违建厂房的认定与法律后果
   根据《城乡规划法》第六十四条，未取得建设工程规划许可证或未按许可内容建设的厂房，属于违法建筑。行政机关可责令限期拆除、没收实物或违法收入，并处罚款。若厂房位于耕地、生态保护区等特殊区域，还可能涉及《土地管理法》第七十七条的严厉处罚（如限期拆除、恢复土地原状）。
   关键点：违建性质不因主体身份（如退役军人）改变，法律适用无特殊豁免。

2. 退役军人身份的特殊考量
   若退役军人因伤残、生活困难等客观原因违建，行政机关在执法时可能依据《行政强制法》第三十五条、第三十六条，优先通过“催告-陈述申辩-听证”程序，给予整改机会。部分地区对退役军人有创业扶持政策（如提供合规用地或补贴），可主动向当地退役军人事务局申请协调。
   建议：若存在实际困难，可准备医疗证明、收入证明等材料，向执法部门说明情况，争取从轻处理。

3. 法律程序与救济途径

   • 行政复议/诉讼：若对违建认定或处罚决定不服，可在收到决定书60日内申请行政复议，或6个月内提起行政诉讼（《行政复议法》第九条、《行政诉讼法》第四十六条）。
     
   • 执行阶段救济：若厂房被强制拆除，可就拆除程序合法性（如是否提前公告、是否保障陈述申辩权）提起诉讼，要求赔偿损失（《国家赔偿法》第四条）。
     注意：诉讼期间原则上不停止执行，但可申请法院裁定暂停（需提供担保）。

4. 合规化建议
   若厂房有保留价值，可尽快补办规划许可、施工许可等手续（需符合当地土地利用规划）。部分地区对历史遗留违建有“补办+罚款”的处置政策，可咨询自然资源部门。
   风险提示：未补办手续前，厂房仍属违建，可能面临再次处罚或强制拆除。

行动建议：

1. 立即停止使用违建厂房，避免扩大损失；
   
2. 整理违建建设时间、用途、投入成本等证据，评估整改可行性；
   
3. 根据自身情况选择协商整改、申请政策扶持或启动法律程序。
   

如有进一步细节（如违建时间、土地性质、是否收到处罚通知等），可向我补充说明，以便提供更精准的分析。