当营运车辆被撞且对方全责时，关于停运费的赔偿问题，确实是一个涉及法律、保险条款及实际操作层面的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、保险公司对停运费的赔偿原则
交强险：交强险主要保障交通事故中第三方的人身伤亡和财产直接损失。对于营运车辆的停运损失这类间接损失，交强险通常是不予赔偿的。交强险的条款中明确排除了因停业、停驶等造成的损失及其他间接损失。
商业三者险：商业三者险的赔偿范围通常也不包括停运损失，因为这被视为间接损失。保险公司在拟定保险条款时，会明确约定对间接损失不负责赔偿。但是，如果投保人在投保时专门附加了针对停运损失的附加险，并且保险公司同意承保并收取了相应保费，那么在符合合同约定的情况下，保险公司是需要对合理的停运损失进行赔偿的。另外，如果保险公司未对免责条款尽到法定的提示和明确说明义务，该条款可能不产生法律效力，此时保险公司也可能需要赔偿停运损失，但这通常需要通过诉讼等方式由法院来判定。
车损险：车损险主要保障的是被保险车辆自身的损失，它并不涉及营运车辆因事故导致的停运损失赔偿。
二、停运费的法律依据及计算方法
法律依据：根据《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第十二条，依法从事货物运输、旅客运输等经营性活动的车辆，因无法从事相应经营活动所产生的合理停运损失，当事人是可以请求侵权人赔偿的。因此，在营运车辆被撞的情况下，受害方有权向事故责任方索赔停运费。
计算方法：停运费的计算通常基于车辆在正常情况下的平均营运收入及停运时间。具体来说，可以通过事故发生前一段时间（如近3-6个月）的营运收入流水明细来确定月平均收入，然后减去营运必要支出（如燃油费、维修费、保险费、税费等），再除以30得到日平均损失，最后乘以实际的维修时间来得出停运损失。如果无法提供具体流水，也可以参考同行业、同类型车辆的平均收入情况来进行计算。
三、索赔流程与建议
收集证据：在索赔过程中，证据的收集至关重要。您需要准备事故责任认定书、车辆营运证明、收入证明以及停运时间证明等相关材料。
与对方协商：在收集好证据后，您可以先与对方车主及保险公司进行协商，提出合理的赔偿要求，并提交相关证据材料。在协商过程中，请保持冷静理性，以事实和证据为依据。
考虑调解或诉讼：如果协商未果，您可以考虑向交通管理部门或相关调解机构申请调解。如果调解也无法解决问题，那么您可能需要向法院提起诉讼来维护自己的合法权益。
四、特别提醒
综上所述，营运车辆被撞后的停运费保险公司通常不直接赔偿，但您可以根据相关法律规定向事故责任方索赔。在处理此类事故时，请务必收集好相关证据，并考虑咨询专业律师以获取法律帮助。