针对你提出的“购车合同承诺两年后无违约金但现在贷款合同中有”的问题，我给出以下分析：

结论：如果4S店在购车合同中承诺两年后提前还款无违约金，但贷款合同中却包含违约金条款，且银行以合同模板为由不能更改，那么你可以与4S店签订补充协议，明确两年后还款产生的利息和违约金由4S店承担。这样的补充协议是有效的，具有法律效力。

分析说明：

1. 合同效力：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同是双方自愿达成的协议，具有法律效力。只要补充协议的内容合法、明确，且双方均签字确认，那么该协议就具有法律效力。

2. 补充协议的作用：补充协议可以对原合同中的不明确或遗漏的内容进行补充和明确。在你的情况下，由于购车合同和贷款合同在违约金方面存在不一致，通过与4S店签订补充协议，可以明确双方的权利和义务，避免未来的纠纷。

3. 违约责任：如果两年后你提前还款，银行根据贷款合同要求你支付违约金，你可以依据补充协议要求4S店承担这部分费用。如果4S店拒绝承担，你可以通过法律途径维护自己的权益。

4. 建议：在签订补充协议时，务必确保协议内容明确、具体，包括但不限于两年后还款的具体时间、金额、违约金计算方式以及4S店承担违约金的具体方式等。同时，建议保留好购车合同、贷款合同以及补充协议的原件，以便未来维权时使用。

综上所述，你可以与4S店签订补充协议来明确两年后还款产生的利息和违约金由4S店承担。这样的协议是有效的，可以保障你的合法权益。如果你有任何其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。