结论：叛逆期小孩进入少管所（现称专门矫治教育机构）是否会留下案底，以及后续如何处理，需根据具体情况判断。若因违法行为被送入且经法院判决有罪，会留下案底；若仅因行为偏差接受矫治教育，未进入司法程序，则不会留下案底。以下从不同角度详细分析：
一、是否会留下案底
若因违法行为被送入且经法院判决有罪：
- 根据我国法律规定，未成年人犯罪，如果经过法院判决有罪，会留下案底，即犯罪记录。这些记录会被保存在公安机关的档案中，但会依法进行封存，非经法定程序不得查阅。
- 法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百八十六条规定，犯罪的时候不满十八周岁，被判处五年有期徒刑以下刑罚的，应当对相关犯罪记录予以封存。犯罪记录被封存的，不得向任何单位和个人提供，但司法机关为办案需要或者有关单位根据国家规定进行查询的除外。依法进行查询的单位，应当对被封存的犯罪记录的情况予以保密。
若仅因行为偏差接受矫治教育，未进入司法程序：
- 如果小孩只是因为叛逆、行为偏差等原因被送入专门矫治教育机构（原少管所），而并未涉及违法行为或未被法院判决有罪，那么不会留下案底。
- 实际情况：专门矫治教育机构主要针对的是有严重不良行为但尚未构成犯罪的未成年人，通过教育、矫治等方式帮助他们改正错误，重新融入社会。
二、后续如何处理
若已留下案底：
- 封存与查询：如前所述，未成年人的犯罪记录会被依法封存。在成年后，如果因就业、出国等原因需要开具无犯罪记录证明，一般只会显示成年后的犯罪记录，未成年时的记录通常不会被显示（除非特定情况，如报考公务员等需要政审的职位）。
- 影响与应对：虽然案底被封存，但在某些特定情况下（如再次犯罪、报考特定职位等），仍可能被查阅。因此，家长应引导小孩树立正确的价值观，遵守法律法规，避免再次陷入法律困境。
若未留下案底：
- 继续教育与引导：家长应继续加强对小孩的教育和引导，帮助他们树立正确的世界观、人生观和价值观。可以通过参加社区活动、志愿服务等方式，让小孩学会承担责任、关爱他人。
- 关注心理健康：叛逆期的小孩往往存在心理问题，家长应关注他们的心理健康状况，及时寻求专业心理咨询师的帮助，解决心理困扰。
三、特殊情况与建议
- 如果小孩被错误地送入专门矫治教育机构：家长应积极与相关部门沟通，了解具体情况，并寻求法律援助，维护小孩的合法权益。
- 如果小孩在矫治教育期间出现违法行为：家长应配合相关部门进行调查和处理，同时加强对小孩的教育和监管，防止类似事件再次发生。
最后，作为家长，面对叛逆期的小孩，应保持冷静和耐心，通过沟通、理解和引导来帮助他们度过这个特殊时期。如果遇到法律问题或困惑，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议。