结论：化工企业拆迁腾退时若未进行土壤调查，后期土壤出现问题，企业仍可能需要承担恢复土壤的责任，并且有可能面临处罚，具体需结合实际情况判断。以下从不同角度进行分析：
一、企业可能需承担恢复土壤的责任
基于环境保护责任：
- 根据《中华人民共和国环境保护法》等相关法律法规，企业作为污染者，有责任对其造成的环境污染进行治理和修复。若化工企业在拆迁腾退过程中未进行土壤调查，导致后期土壤出现问题，企业很可能被认定为污染者，从而需要承担恢复土壤的责任。
基于合同或协议约定：
- 如果化工企业在拆迁腾退过程中与政府或其他相关方签订了合同或协议，其中明确规定了土壤调查和修复的责任归属，那么企业需按照合同或协议的约定来履行责任。若未进行土壤调查且后期土壤出现问题，企业可能因违反合同或协议而需承担恢复土壤的责任。
二、企业可能面临的处罚
行政处罚：
- 如果化工企业未按照相关法律法规的要求进行土壤调查，且后期土壤出现问题，环保部门等有权对企业进行行政处罚。处罚措施可能包括罚款、责令限期治理等。具体处罚力度将取决于土壤污染的程度、企业的过错程度以及相关法律法规的规定。
刑事责任：
- 在极端情况下，如果化工企业的行为构成犯罪（如污染环境罪），企业及其相关责任人员可能面临刑事责任。这通常发生在土壤污染非常严重，且企业存在故意或重大过失的情况下。
三、特殊情况考虑
不可抗力或第三方原因：
- 如果土壤污染是由于不可抗力（如自然灾害）或第三方原因（如其他企业的污染行为）造成的，且化工企业能够证明其没有过错或无法预见、无法避免、无法克服该污染，那么企业可能不需要承担恢复土壤的责任或面临处罚。但这种情况需要企业提供充分的证据来支持其主张。
已尽合理注意义务：
- 如果化工企业在拆迁腾退过程中已经尽到了合理的注意义务，如进行了必要的土壤初步调查、采取了预防措施等，但后期土壤仍然出现问题，且该问题并非由企业直接造成，那么企业可能不需要承担全部恢复土壤的责任或面临处罚。但这也需要根据具体情况和法律法规的规定来判断。
建议：化工企业在拆迁腾退过程中应严格遵守相关法律法规的要求，进行必要的土壤调查，并采取措施预防土壤污染。如果后期土壤出现问题，企业应积极配合政府和相关方的调查和处理工作，并承担相应的责任。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。