结论：在分公司有营业执照的情况下，仲裁分公司后，若分公司财产不足以承担责任，是可以再次仲裁总公司要求其承担补充清偿责任的。
详细分析：
分公司作为仲裁对象的合法性：
- 根据《中华人民共和国民法典》和《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，分公司若依法登记并取得营业执照，则具有相应的法律地位，可以作为劳动争议仲裁的当事人。这意味着，劳动者可以直接以有营业执照的分公司为被申请人提起劳动仲裁。
分公司与总公司的责任关系：
- 分公司作为分支机构，不具有独立的法人资格，其民事责任最终由总公司承担。在仲裁实践中，如果裁决分公司承担责任，但分公司的财产不足以履行裁决，那么总公司需要承担补充清偿责任。
再次仲裁总公司的可能性：
- 在仲裁分公司后，如果发现分公司的财产不足以承担责任，劳动者可以申请追加总公司为共同被申请人，或者另行向总公司提起仲裁，要求总公司承担补充清偿责任。这是因为总公司的责任是补充性的，即在分公司无法履行责任时，总公司需要承担剩余的责任。
实际操作建议：
- 在与分公司进行经济往来或签订劳动合同时，应仔细审查其营业执照及授权情况，以明确其主体资格和履约能力。这有助于在发生纠纷时，更准确地判断责任主体和追责途径。
- 如果已经对分公司提起了仲裁，并获得了裁决，但在执行过程中发现分公司财产不足以承担责任，应及时向仲裁机构或法院申请追加总公司为共同被申请人或另行提起仲裁，以确保自身权益得到充分保障。
法律后果：
- 如果劳动者未能及时追加总公司为共同被申请人或另行提起仲裁，可能会导致裁决无法得到有效执行，从而损害劳动者的合法权益。
- 总公司如果未能履行补充清偿责任，可能会面临法律制裁，如被强制执行、列入失信被执行人名单等。
综上所述，仲裁分公司后，在分公司财产不足以承担责任的情况下，是可以再次仲裁总公司要求其承担补充清偿责任的。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。