刑事法拍宅基地涉及违法所得流拍后，通常会根据案件具体情况和法律规定，采取以下处理方式：

1. 重新确定拍卖底价并再次拍卖

   • 根据《最高人民法院关于刑事裁判涉财产部分执行的若干规定》第十二条，对于刑事法拍中涉及违法所得的宅基地，如果第一次拍卖流拍，法院可以在三十日内安排在同一拍卖平台再次拍卖。再次拍卖时，可以酌情降低保留价，但降低的数额不得超过前次保留价的百分之二十。这是为了增加拍卖的成功率，确保违法所得能够得到有效处置。

2. 以物抵债或变卖处理

   • 如果经过再次拍卖仍然流拍，且申请执行人或者其他执行债权人拒绝接受或者依法不能接受该不动产抵债的，人民法院可以在第三次拍卖流拍后，将该不动产进行变卖处理。变卖的方式可以参照市场价格或者评估价格进行，以确保变卖价格的合理性。
   • 特别地，对于宅基地等不动产，由于其特殊性，变卖时可能需要考虑当地的市场行情、政策规定以及买受人的资格等因素。

3. 上缴国库或返还被害人

   • 如果经过拍卖、变卖等程序后，宅基地仍然无法处置或者处置所得不足以清偿违法所得的，法院可能会根据案件具体情况，将剩余部分上缴国库或者返还给被害人（如果被害人明确且能够确认）。这是为了保障法律的公正性和受害人的合法权益。

4. 考虑其他执行措施

   • 在处理流拍宅基地的过程中，法院还可能会考虑采取其他执行措施，如查封、扣押其他财产、限制被执行人的高消费行为等，以迫使被执行人履行义务或者增加其违法成本。

在处理过程中，需要注意以下几点：

• 严格遵守法律规定：法院在处理刑事法拍宅基地涉及违法所得流拍的问题时，必须严格遵守相关法律法规的规定，确保程序的合法性和公正性。
• 保障当事人权益：在处理过程中，要充分保障申请执行人、被执行人以及其他相关当事人的合法权益，确保他们的知情权、参与权等得到充分行使。
• 考虑社会效果：在处理此类问题时，还需要考虑社会效果，避免因为处理不当而引发社会矛盾或者不良影响。

建议：

• 如果您是申请执行人或者被执行人，在处理此类问题时，建议积极与法院沟通，了解处理进展和结果，并根据自身情况提出合理的意见和建议。
• 如果您对处理结果有异议或者认为法院的处理程序存在违法之处，可以依法向法院提出申诉或者申请复议，以维护自己的合法权益。