在交通事故中，关于主次责任下的鉴定费用承担问题，这确实是一个需要细致分析的情况。以下是我为您提供的详细解答：
一、鉴定费用承担的基本原则
“谁主张、谁举证”原则：
- 在交通事故处理中，如果一方对车辆损失、伤残程度等提出赔偿要求，并需要进行鉴定以证明其损失或伤残程度，那么通常由该方先行垫付鉴定费用。这是因为鉴定是为了支持其赔偿请求而进行的，所以费用应由提出请求的一方承担。
按责任比例分担原则：
- 如果双方对事故责任有争议，且都希望通过鉴定来明确责任或损失程度，那么鉴定费用可以根据双方在事故中的责任比例进行分担。例如，在主次责任的情况下，主要责任方可能需要承担较大比例的鉴定费用，而次要责任方则承担较小比例。
二、具体情形下的鉴定费用承担
单方委托鉴定：
- 如果一方自行委托鉴定机构进行鉴定，且另一方不认可该鉴定结果，那么鉴定费用一般由委托方自行承担。因为这是单方面的行为，没有得到另一方的同意或参与，所以费用不应由另一方承担。
共同委托或法院/交警部门指定鉴定：
- 如果双方共同委托鉴定机构进行鉴定，或者由法院、交警部门指定鉴定机构进行鉴定，那么鉴定费用通常按照责任比例分担。这种情况下，鉴定是为了解决双方的争议而进行的，所以费用应由双方根据责任比例共同承担。
保险公司责任：
- 如果车辆投保了相关险种（如车损险、第三者责任险等），并且保险公司同意承担鉴定费用（通常在保险合同中有约定），那么鉴定费用可以由保险公司支付。但需要注意的是，保险公司可能只承担与其赔偿责任相对应部分的鉴定费用。例如，如果保险公司认定肇事方在该起事故中负有责任，并且鉴定费用是为了确定损失程度而产生的，那么保险公司可能会承担这部分费用。
诉讼过程中的特殊情况：
- 在诉讼过程中，如果法院认为有必要进行鉴定以明确相关事实或损失程度，根据“谁主张、谁举证”的原则以及公平合理的原则，鉴定费用通常会由申请鉴定的一方先行垫付。待判决后，根据鉴定结果是否被采纳及双方责任比例等因素，决定鉴定费用的最终承担者。
三、综合建议
- 在处理交通事故中的鉴定费用承担问题时，建议双方首先尝试通过协商解决。如果协商不成，可以寻求交警部门或法院的帮助进行调解或判决。
- 在进行鉴定前，最好先了解清楚保险公司的赔付政策和保险合同中的相关约定，以便在需要时能够及时获得保险公司的支持。
- 如果对鉴定结果有异议，可以在规定的时间内提出复议或重新鉴定申请，但需要注意这可能会产生额外的费用和时间成本。
综上所述，交通事故中的鉴定费用承担问题需根据具体情况来确定，包括鉴定方式、鉴定结果的采信情况、当事人在事故中的责任以及保险公司的赔付责任等。在处理此类问题时，建议咨询专业律师或相关机构以获取更准确的法律意见和帮助。