结论：被起诉且判决书已下达的情况下，与第三方签订的还款协议是否有效，需根据具体情况判断，主要取决于协议内容是否合法、是否损害他人权益、是否违反法院判决或执行措施等因素。以下从不同角度详细分析：

1. 协议内容合法性是基础

• 有效情形：若还款协议内容合法（如明确还款金额、期限、方式等），且双方意思表示真实（无欺诈、胁迫等），协议原则上有效。例如，您因借款纠纷被起诉，判决要求还款10万元，此时您与第三方（如亲友）签订协议，约定分期偿还10万元本金及合理利息，该协议合法有效。
• 无效情形：若协议内容违法（如约定高利贷、逃避债务等），或存在恶意串通损害他人权益（如与第三方虚构债务转移财产），则协议无效。例如，您与第三方签订“虚假还款协议”，试图将财产转移至第三方名下以逃避法院执行，此类协议因损害债权人利益而无效。

2. 需考虑法院判决或执行措施的影响

• 判决已生效但未执行：若判决书已生效但尚未进入执行阶段，您与第三方签订还款协议原则上不影响判决效力，但需注意协议履行可能涉及判决义务的履行。例如，判决要求您向债权人A还款10万元，您与第三方B签订协议约定由B代为偿还，此时需确保A同意该债务转移（否则您仍需承担还款责任）。
• 判决已进入执行阶段：若法院已采取执行措施（如冻结银行账户、查封财产等），您与第三方签订还款协议可能受限制。例如，法院已冻结您的账户，您与第三方签订协议约定通过第三方账户还款，需向法院申报并经同意，否则可能构成“规避执行”行为，导致协议无效或面临司法处罚。

3. 协议不得损害债权人利益

• 优先履行判决义务：即使您与第三方签订还款协议，仍需优先履行法院判决确定的义务。例如，判决要求您向债权人A还款10万元，您与第三方B签订协议约定先偿还B的5万元，此类协议可能因损害A的优先受偿权而无效。
• 不得转移财产逃避执行：若您通过与第三方签订还款协议转移财产（如将房产过户至第三方名下），导致无财产可供执行，债权人可申请撤销该协议（依据《民法典》第538-539条），并追究您的法律责任。

4. 实务建议

• 协议签订前：建议先履行法院判决或与债权人协商达成和解（如分期还款、减免利息等），再与第三方签订协议，避免协议因违反判决或损害债权人利益而无效。
• 协议签订时：明确约定协议目的（如“为履行法院判决而签订”）、还款来源（如“以第三方借款偿还”）、违约责任（如“若未按期还款，需承担违约金”）等条款，增强协议效力。
• 协议签订后：保留履行证据（如转账记录、收条等），并主动向法院或债权人通报协议履行情况，避免被认定为“逃避执行”。

总结：与第三方签订还款协议的效力需结合协议内容、法院判决执行情况、债权人利益保护等因素综合判断。若您面临此类问题，建议直接向我咨询，提供判决书、还款协议等具体材料，以便我为您分析协议效力及风险，并制定应对方案。