股东退股时，竞业协议可以约定商事仲裁。以下是对此问题的详细分析：

1. 竞业协议与商事仲裁的关联性

   • 竞业协议，即竞业限制协议，是用人单位与劳动者约定的，在解除或者终止劳动合同后，劳动者不得到与本单位生产或者经营同类产品、从事同类业务的有竞争关系的其他用人单位工作，或者自己开业生产或者经营同类产品、从事同类业务的协议。这种协议在股东退股的情境下，同样可以适用，尤其是当股东同时担任公司重要职务，掌握公司核心商业秘密或技术秘密时。
   • 商事仲裁是一种替代性纠纷解决机制，它允许双方当事人在合同中约定，当发生争议时，将争议提交给仲裁机构进行裁决，而非直接通过法院诉讼解决。商事仲裁具有高效、灵活、保密性强等特点，因此，在竞业协议中约定商事仲裁作为争议解决方式，是合法且可行的。

2. 竞业协议中约定商事仲裁的法律依据

   • 根据《中华人民共和国仲裁法》的相关规定，平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。股东退股时的竞业协议，本质上属于合同纠纷范畴，因此，双方可以在协议中约定商事仲裁作为争议解决方式。
   • 同时，根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。虽然该条款直接针对的是劳动合同中的竞业限制，但股东退股时的竞业协议，在性质上与劳动合同中的竞业限制有相似之处，均涉及对商业秘密或技术秘密的保护，因此，可以参照该条款的精神，在竞业协议中约定商事仲裁。

3. 竞业协议中约定商事仲裁的注意事项

   • 明确仲裁条款：在竞业协议中，应明确约定仲裁条款，包括仲裁机构的选择、仲裁规则的适用、仲裁地点的确定等。这有助于确保在争议发生时，双方能够迅速、有效地将争议提交给仲裁机构进行裁决。
   • 确保仲裁条款的合法性：仲裁条款应符合法律法规的规定，不得违反法律、行政法规的强制性规定。例如，仲裁条款不得约定将争议提交给非法仲裁机构进行裁决，或者约定仲裁机构对争议事项无管辖权等。
   • 注意仲裁条款的独立性：仲裁条款应具有独立性，即仲裁条款的效力不受合同其他条款效力的影响。即使合同其他条款因某种原因无效或被撤销，仲裁条款仍然有效，双方仍应按照仲裁条款的约定将争议提交给仲裁机构进行裁决。

建议：在股东退股时，如果双方希望约定竞业协议，并希望以商事仲裁作为争议解决方式，那么应在竞业协议中明确约定仲裁条款，并确保仲裁条款的合法性和独立性。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。