嫌疑人被抓三个月，案件程序可能处于以下几个阶段，具体取决于案件的复杂性和进展情况：

1. 侦查阶段：

   • 一般情况：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的规定，公安机关对被拘留的人，认为需要逮捕的，应当在拘留后的三日以内，提请人民检察院审查批准。在特殊情况下，提请审查批准的时间可以延长一日至四日。对于流窜作案、多次作案、结伙作案的重大嫌疑分子，提请审查批准的时间可以延长至三十日。人民检察院应当自接到公安机关提请批准逮捕书后的七日以内，作出批准逮捕或者不批准逮捕的决定。因此，在正常情况下，拘留后的最长侦查羁押期限为37天（30天+7天）。但若案件复杂，如涉及多个犯罪嫌疑人、多起犯罪事实或需要进一步收集证据等，公安机关可能会在逮捕后继续侦查，此时侦查羁押期限可以延长。根据法律规定，对犯罪嫌疑人逮捕后的侦查羁押期限不得超过二个月。案情复杂、期限届满不能终结的案件，可以经上一级人民检察院批准延长一个月。对于符合特定情形的案件，如交通十分不便的边远地区的重大复杂案件、重大的犯罪集团案件等，还可以进一步延长侦查羁押期限。
   • 三个月时的可能情况：如果案件在三个月时仍处于侦查阶段，可能意味着案件较为复杂，公安机关正在深入调查取证，或者已经提请延长侦查羁押期限并得到了批准。

2. 审查起诉阶段：

   • 一般情况：公安机关侦查终结后，会将案件移送人民检察院审查起诉。人民检察院认为犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，会作出起诉决定，并按照审判管辖的规定，向人民法院提起公诉。审查起诉阶段一般为一个半月，但也可以根据案件情况延长半个月。
   • 三个月时的可能情况：如果案件在三个月时已经进入审查起诉阶段，可能意味着公安机关已经完成了侦查工作，并将案件移送给了人民检察院。此时，人民检察院正在对案件进行审查，以决定是否提起公诉。

3. 审判阶段（虽不太可能在三个月时直接进入，但为全面分析需提及）：

   • 一般情况：如果人民检察院决定提起公诉，案件将进入审判阶段。人民法院会在受理案件后的一定期限内（如普通程序一般为二至三个月）进行审理，并作出判决。
   • 三个月时的可能情况：在正常情况下，案件不太可能在嫌疑人被抓三个月时就直接进入审判阶段。但如果案件已经历了较长的侦查和审查起诉阶段，且法院迅速安排了庭审，理论上也存在这种可能性，不过这种情况较为罕见。

针对您的情况，我建议：

• 了解案件进展：您可以尝试通过合法途径（如委托律师）了解案件的具体进展情况，包括案件目前处于哪个阶段、公安机关或人民检察院已经采取了哪些措施等。
• 准备应对策略：根据案件的进展情况，您可以与律师一起制定应对策略，如准备辩护材料、申请取保候审等。
• 保持沟通：与律师保持密切沟通，及时了解案件的最新动态，并根据律师的建议调整应对策略。

最后，每个案件的具体情况都有所不同，因此上述分析仅为一般性说明。如果您对案件的具体情况有进一步的问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。