被关押三个月的刑事案件，通常意味着犯罪嫌疑人已被采取刑事拘留或逮捕措施，案件已进入刑事诉讼程序。具体处理方式需结合案件阶段、性质及证据情况综合判断。以下是分情况说明：

1. 若案件仍处于侦查阶段（公安机关主导）

• 拘留期限：刑事拘留最长30日，加上检察院审查逮捕的7日，总计37日。若被关押三个月，可能已转为逮捕措施（逮捕后羁押期限一般2个月，可延长至7个月）。
• 处理建议：
  • 律师介入：家属应尽快委托律师会见犯罪嫌疑人，了解案情、提供法律帮助，并向公安机关提交取保候审申请（若符合条件，如可能判处缓刑、无社会危险性等）。
  • 证据审查：律师可要求公安机关出示拘留、逮捕的法律依据及证据材料，核查是否存在超期羁押或程序违法。
  • 沟通进展：定期与办案机关沟通，了解案件是否已移送检察院审查起诉。

2. 若案件已进入审查起诉阶段（检察院主导）

• 期限：检察院审查起诉期限一般为1个月，可延长15日；若案件复杂或需补充侦查，期限可能更长。
• 处理建议：
  • 阅卷权：律师可查阅、复制案卷材料，全面分析证据，提出无罪、罪轻或量刑建议（如从轻、减轻处罚情节）。
  • 认罪认罚协商：若犯罪嫌疑人认罪，律师可协助与检察院沟通，争取从宽处理（如建议缓刑、减少量刑幅度）。
  • 不起诉申请：若证据不足或符合法定不起诉条件（如情节轻微、已过追诉时效等），律师可提交不起诉意见书。

3. 若案件已进入审判阶段（法院主导）

• 期限：法院审理期限一般为2个月，可延长至6个月；若需补充侦查或发回重审，期限可能更长。
• 处理建议：
  • 庭审辩护：律师需制定辩护策略，针对指控事实、证据及法律适用提出异议（如排除非法证据、主张正当防卫等）。
  • 量刑辩护：结合犯罪情节、社会危害性及被告人悔罪表现，争取从轻、减轻处罚（如自首、立功、退赃退赔等）。
  • 二审救济：若一审判决不利，律师可协助提起上诉，争取二审改判或发回重审。

4. 特殊情形处理

• 超期羁押：若关押时间超过法定期限，律师可向检察院申请立案监督，或直接向法院提起申诉，要求解除强制措施。
• 证据不足：若案件存在事实不清、证据不足，律师可申请检察院作出不起诉决定，或要求法院判决无罪。
• 程序违法：若办案机关存在刑讯逼供、非法取证等行为，律师可申请排除非法证据，并追究相关人员责任。

总结：被关押三个月的刑事案件，需根据具体阶段采取针对性措施。家属应第一时间委托律师介入，通过会见、阅卷、沟通办案机关等方式，最大限度维护犯罪嫌疑人的合法权益。若您有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件情况。