在特殊情况下不能退还过期食品时，赔偿中过期食品价格的计算需根据具体情况综合判断，通常以实际交易价格为基础，结合商品性质、过错程度等因素确定。具体分析如下：

1. 以实际交易价格为基准
   根据《消费者权益保护法》第五十五条，若经营者存在欺诈行为（如明知过期仍销售），赔偿金额通常为消费者购买商品的价款或接受服务的费用的三倍。此时，过期食品的价格计算应以其实际支付金额为准。例如，若消费者以100元购买了过期食品，则赔偿基数为100元。

2. 考虑商品性质与市场价值
   若食品因过期导致价值显著降低（如易腐食品变质），实际交易价格可能无法反映其真实价值。此时，可结合商品的市场平均价格、保质期剩余时间等因素调整赔偿基数。例如，临近保质期的食品若以折扣价销售，赔偿时可能需按折扣后的价格计算。

3. 经营者过错程度的影响
   若经营者能证明过期非因自身故意（如库存管理疏忽），且消费者未因食用过期食品遭受实际损害，赔偿金额可能适当减少。但需注意，经营者仍需承担退还货款等基本责任，价格计算仍以实际交易金额为原则。

4. 特殊情形下的价格认定

   • 赠品或捆绑销售：若过期食品为赠品或捆绑销售的一部分，赔偿时可能需按主商品与赠品的价值比例分摊计算。
     
   • 批量购买：若消费者批量购买过期食品，赔偿基数通常为总价款，但经营者可主张按单件价格分别计算（需以合同或交易习惯为依据）。
     

建议：若您遇到此类纠纷，可先与经营者协商，明确过期食品的实际交易价格及赔偿方案；若协商无果，可收集购物凭证、商品照片等证据，通过市场监管部门投诉或诉讼途径维权。如有进一步疑问，欢迎直接向我咨询。