交通肇事有谅解书，检察院不一定会起诉，但谅解书是一个重要的考量因素，有可能促使检察院作出不起诉决定。以下是对此问题的详细分析：

一、谅解书的性质与作用

谅解书是在交通事故发生后，肇事者与受害者或其家属之间达成的一种书面和解协议。它表明肇事者对自己的行为表示悔过，并向受害者或其家属道歉，同时承诺进行经济赔偿。受害者或其家属则在谅解书中表示对肇事者的行为予以谅解，并可能请求司法机关在从轻或减轻处罚方面给予考虑。谅解书在法律上具有一定的效力，它反映了肇事者的悔罪态度和受害者的态度，是检察院在决定是否起诉时的一个重要参考因素。

二、检察院决定是否起诉的依据

1. 公诉案件性质：交通肇事罪属于公诉案件，其举证责任在公诉机关，即检察院。因此，即使被害人或其家属出具了谅解书，也不能直接决定检察院是否起诉。
2. 法律规定：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。这包括犯罪情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的；经特赦令免除刑罚等情形。在交通肇事案件中，如果犯罪嫌疑人具有自首、立功、积极赔偿并取得被害人谅解等从轻或减轻处罚的情节，且这些情节足以表明其犯罪情节轻微，依法不需要判处刑罚或可以免除刑罚，那么检察院可能会考虑不起诉。
3. 综合考量因素：检察院在决定是否起诉时，会综合考虑案件的所有相关因素，包括但不限于犯罪情节、犯罪嫌疑人的态度（如自首、立功）、对社会的危害程度以及是否取得谅解书等。

三、谅解书对检察院决定的具体影响

1. 从宽处理的可能性：如果交通肇事罪的犯罪情节相对轻微，比如造成的人员伤亡和财产损失程度较低，且犯罪嫌疑人积极履行民事赔偿责任并取得了被害人或其家属的充分谅解，那么检察院在考虑是否起诉时，可能会将谅解书作为从宽处理的一个因素，从而作出不起诉决定。
2. 非决定性因素：然而，谅解书并非决定性因素。如果犯罪后果特别严重，如存在肇事逃逸、酒驾醉驾等恶劣情节，即便存在谅解书，检察机关依然有可能依照法律规定提起公诉。因为检察院需要综合考虑案件的整体情况，确保法律的公正实施和社会的公共利益。在量刑时，检察院会将谅解这一因素纳入考量，一般会对被告人从轻处罚，可能适用缓刑等。

四、实际操作中的建议

1. 积极赔偿与悔罪：在交通肇事案件中，肇事者应当积极赔偿损失并真诚悔罪，以争取受害方的谅解。这有助于在量刑时获得从轻处罚，甚至有可能促使检察院作出不起诉决定。
2. 了解法律程序与规定：肇事者也应当了解法律程序和规定，配合调查取证工作，并尊重检察院和法院的判决结果。在处理此类案件时，应当遵循法律程序和政策要求，确保公正、公平地维护各方当事人的合法权益。

总结来说，交通肇事有谅解书并不意味着检察院一定不会起诉，但谅解书是一个重要的考量因素。具体的法律后果还需根据案件的具体情况和相关法律规定来判断。如果您或您身边的人遇到了此类问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。