应急管理局查封违法储存并没收违法所得后，相关处理流程及法律依据如下：

1. 查封与没收的法定程序
   根据《中华人民共和国安全生产法》第六十五条及《行政强制法》相关规定，应急管理局在发现企业或个人存在违法储存危险物品（如易燃易爆品、危险化学品等）时，有权采取查封场所、扣押设施设备等行政强制措施。若经调查确认存在违法所得（如通过违法储存行为获取的收益），应急管理局可依据《安全生产法》第九十三条没收违法所得，并处以罚款。
   关键点：查封与没收需出具书面决定书，明确违法事实、法律依据及救济途径（如申请行政复议或提起行政诉讼的期限）。

2. 违法所得的认定与处理

   • 认定标准：违法所得通常指通过违法行为直接获得的全部收入，扣除成本后的净收益。例如，违法储存危险化学品后销售所得的利润。
     
   • 处理方式：
     
     1. 没收上缴国库：根据《行政处罚法》第七十二条，没收的违法所得应全额上缴国库，不得截留、私分或变相私分。
        
     2. 罚款叠加：除没收违法所得外，应急管理局还可根据违法情节（如储存数量、危害后果等）处以罚款，罚款金额可能为违法所得的数倍（如《危险化学品安全管理条例》第八十条规定的罚款幅度为违法所得10倍以下）。
        

3. 当事人的权利救济

   • 陈述申辩权：在收到查封、没收决定书后，当事人有权在规定期限内（通常为5-7日）向应急管理局提出书面陈述或申辩，要求重新核实违法事实或减轻处罚。
     
   • 行政复议或诉讼：若对处罚决定不服，当事人可在60日内申请行政复议（向上一级应急管理部门或本级政府），或在6个月内直接向法院提起行政诉讼。
     提示：救济期间不停止处罚执行，但若法院裁定停止执行，则查封、没收措施可能暂停。

4. 特殊情形处理

   • 无违法所得或违法所得难以计算：若违法行为未产生收益（如尚未销售即被查封），应急管理局可仅处以罚款，罚款标准依据相关法规的最低限额（如《安全生产法》第九十三条规定的罚款下限为10万元）。
     
   • 涉嫌犯罪的移送：若违法储存行为构成犯罪（如非法经营罪、危险作业罪），应急管理局应将案件移送公安机关立案侦查，此时没收程序可能转为刑事司法程序中的追缴或罚金。

建议行动：

• 若您是当事人，首先核对查封、没收决定书中的违法事实是否准确，收集相关证据（如进货凭证、销售记录等）以备申辩或诉讼；
  
• 若需进一步了解具体法规适用或程序细节，可直接向我咨询，我将结合您的案件情况提供针对性分析。