注销国有商业用地的土地证可能涉及违反以下法律规定，具体分析如下：

1. 《中华人民共和国土地管理法》相关规定
   根据《土地管理法》第五十八条，国有土地使用权需经法定程序方可收回或注销，包括：

   • 公共利益需要（如基础设施建设、城市规划调整等）；
     
   • 土地闲置满两年且未被批准延期开发；
     
   • 单位撤销、迁移等导致土地使用权终止；
     
   • 公路、铁路、机场等经核准报废。
     若注销行为未满足上述条件之一，或未依法补偿土地使用权人，则可能构成违法。

2. 《中华人民共和国城市房地产管理法》相关规定
   该法第二十条规定，国家对土地使用者依法取得的土地使用权，在特殊情况下可提前收回，但需满足：

   • 公共利益目的；
     
   • 依法给予补偿。
     若注销土地证未履行补偿程序，或补偿标准不合法，可能侵犯土地使用权人权益。

3. 《中华人民共和国行政许可法》相关规定
   土地证属于行政许可范畴，注销行为需遵循：

   • 程序合法性：需通过听证、公告等程序保障利害关系人权利；
     
   • 主体适格性：仅有权机关（如自然资源主管部门）可实施注销。
     若注销程序存在瑕疵（如未通知权利人、未听取陈述申辩），可能因程序违法被撤销。

4. 《中华人民共和国民法典》相关规定
   根据民法典第三百五十八条，土地使用权因公共利益被提前收回的，应依法给予补偿。
   若注销行为导致土地使用权人损失（如地上建筑物、附着物价值），未补偿或补偿不足可能构成侵权。

实务建议：

• 若土地证被违法注销，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，要求撤销注销决定并恢复权利；
  
• 若涉及补偿争议，可主张按照市场价值评估补偿标准，并要求支付利息或赔偿损失；
  
• 需注意，若土地使用权人存在违法行为（如擅自改变土地用途、长期闲置等），注销行为可能具有合法性，但仍需严格遵循法定程序。
  

如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我会结合事实与证据提供针对性分析。