若发现工资少了100元，可按以下步骤处理：

1. 核实工资明细与考勤记录
   首先应要求用人单位提供完整的工资条（含应发工资、扣除项、实发金额等明细），并核对考勤记录、加班时长、绩效评分等与工资计算直接相关的数据。若发现计算错误（如考勤扣款错误、社保公积金基数不符等），可直接向财务或人事部门提出书面异议，要求补发差额。

2. 确认是否存在合法扣款情形
   根据《工资支付暂行规定》第十六条，用人单位仅可在以下情形下扣减工资：

   • 代扣代缴个人所得税、社保个人部分等法定项目；
     
   • 法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；
     
   • 因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，可按劳动合同约定扣款（但每月扣减不得超过当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准）。
     若扣款不符合上述情形，用人单位行为涉嫌违法。

3. 协商与投诉途径

   • 协商：优先与用人单位沟通，要求书面说明扣款原因并补发差额。
     
   • 投诉：若协商无果，可向当地劳动监察大队投诉（需提供劳动合同、工资条、考勤记录等证据），劳动监察部门将责令用人单位限期支付。
     
   • 仲裁：若投诉未解决，可在劳动关系终止后1年内申请劳动仲裁，主张补发工资及50%-100%的赔偿金（《劳动合同法》第八十五条）。

4. 注意事项

   • 保留所有书面证据（如工资条、考勤记录、沟通记录等）；
     
   • 避免因小额纠纷擅自离职，可能影响经济补偿金主张；
     
   • 若用人单位存在系统性克扣工资行为，可同时主张被迫解除劳动合同并要求经济补偿。

建议行动顺序：先核实计算错误→确认扣款合法性→协商补发→投诉/仲裁。若需进一步分析具体情形，可提供更多细节（如劳动合同条款、扣款说明等）向我咨询。