虚开下游企业确实存在被稽查的风险，这一风险主要来源于税务机关对虚开发票行为的严厉打击以及上下游企业交易链条的紧密关联性。以下从多个角度对这一问题进行详细分析：
一、税务稽查的必然性
税务机关在打击虚开发票行为时，通常会采取“顺藤摸瓜”的策略，即从已知的虚开企业出发，追溯其上下游企业，以查明整个虚开链条。因此，如果下游企业与虚开的上游企业存在交易关系，那么下游企业就很可能成为税务稽查的对象。
二、下游企业可能面临的法律风险
进项税额转出与补税：
- 若下游企业取得了上游企业虚开的增值税专用发票并已申报抵扣进项税额，税务机关在稽查过程中发现后，通常会要求企业进行进项税额转出处理，并补缴相应的增值税税款。
企业所得税调整：
- 虚开的发票不能作为企业所得税税前扣除的凭证。因此，下游企业需对已在税前扣除的相关成本进行调整，并补缴相应的企业所得税。若能重新取得合法有效的凭证，则仍可在税前扣除。
行政处罚：
- 若税务机关认定下游企业知道或应当知道取得的是虚开发票，可能会被视为偷税行为。除了补缴税款和滞纳金外，企业还可能面临罚款，罚款金额通常为不缴或少缴税款的百分之五十以上五倍以下。
纳税信用降级：
- 企业的纳税信用等级会受到影响，导致在发票领用、出口退税、银行贷款等方面受到限制。
刑事处罚：
- 如果下游企业与上游企业存在共谋或故意取得虚开发票用于骗取国家税款，且数额较大，可能会触犯刑法中的相关罪名，如虚开增值税专用发票罪等。根据《中华人民共和国刑法》的规定，虚开税款数额较大或有其他严重情节的，将面临严厉的刑事处罚。
三、下游企业的应对措施
积极配合调查：
- 在接到税务机关或司法机关的调查通知后，下游企业应第一时间积极响应，全面配合调查工作。按照要求提供与交易相关的合同、发票、资金往来记录及货物运输单据等资料，并如实陈述业务真实情况。
核实业务真实性：
- 企业需对与上游企业的所有业务进行全面自查，确保每笔交易均真实发生。收集并保存能够证明业务真实性的证据，如货物入库单、验收单、运输凭证等。一旦发现任何问题，应立即采取措施进行整改。
寻求专业法律支持：
- 建议聘请经验丰富的税务律师或税务顾问，为企业提供专业的法律意见和应对策略。他们可以帮助企业准确理解相关法律法规，分析面临的风险，并指导企业采取有效措施进行应对。
加强合规管理：
- 下游企业应建立健全的合规管理制度，确保与上游企业的交易活动合法合规。定期对供应商进行资质审核，避免与存在违法行为的上游企业合作。同时，保留好所有交易的相关证据，以备不时之需。
四、特殊情况下的处理
- 如果下游企业能够证明业务真实且对上游企业的虚开行为不知情，属于善意取得虚开发票，通常只需作进项税额转出并补缴已抵扣税款，一般不会被处以罚款或追究刑事责任。但企业仍需加强后续的合规管理，防止类似情况再次发生。
总结与建议：虚开下游企业确实存在被稽查的风险，且可能面临严重的法律后果。因此，下游企业应时刻保持警惕，加强与上游企业的沟通与合作，确保交易的真实性和合法性。一旦发现上游企业存在违法行为，应立即采取措施与之切割，并向相关部门报告以降低自身法律风险。同时，企业应积极寻求专业法律支持，加强合规管理，以应对可能的税务稽查和法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。