结论：开车到等待区（待转区）突然红灯亮起并停下来，是否扣分需根据具体情况判断。一般情况下，合法进入待转区后遇红灯停车等待不会扣分；但如果是红灯时闯入待转区或存在其他违规行为，则可能会受到处罚。
一、不扣分的情况
合法进入待转区后遇红灯：
- 待转区的设置旨在提高路口通行效率。当车辆按照交通信号指示（如直行或左转信号灯亮绿灯）正常进入待转区后，若随后信号灯变为红灯，此时在待转区内停车等待下一个绿灯亮起再继续行驶，是合理且合规的操作。
- 这种行为不构成违章，因此通常不会被扣分。这一原则适用于大多数地区，尽管个别地方可能有特殊规定，但这种情况较为少见。
黄灯时已过停止线：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第三十八条的规定，“黄灯亮时，已越过停止线的车辆可以继续通行”。如果车辆在黄灯亮起时已经越过了停止线，那么即使随后红灯亮起，车辆选择停下来等待也不会因“继续通行”而被扣分。
二、可能扣分的情况
红灯时进入待转区：
- 如果车辆是在直行信号灯为红灯时擅自闯入待转区，这明显违反了交通信号灯的规定，属于违章行为。
- 对于此类行为，根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，驾驶机动车不按交通信号灯指示通行的，一次记6分，并可处警告或者二十元以上二百元以下罚款。
待转区内违法停车：
- 虽然车辆在合法进入待转区后遇红灯停车等待通常不会扣分，但如果停车时间过长，影响了其他车道的正常通行，或者违反了待转区内明确的交通标志、标线禁止停车的规定，也可能被认定为违法行为而受到处罚。
- 例如，如果待转区内有明确的禁停标志，而车辆仍然在此停车，那么这种行为将被视为违章停车，根据相关规定，可能会受到扣分和罚款的处罚。
三、建议与注意事项
- 严格遵守交通规则：驾驶员应密切关注交通信号灯的变化，并严格按照交通规则的指示行驶，避免因违规行为而受到处罚。
- 注意交通标志和标线：在进入待转区前，驾驶员应仔细观察路口的交通标志和标线，确保自己有权且合法地进入待转区。
- 确保安全停车：在待转区红灯停车时，驾驶员应确保自己的停车行为不会影响其他车辆和行人的正常通行，同时密切关注交通信号灯的变化及周围的交通状况，以确保自身和他人的安全。
法律依据：
- 《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第三十八条：机动车信号灯和非机动车信号灯表示：（一）绿灯亮时，准许车辆通行，但转弯的车辆不得妨碍被放行的直行车辆、行人通行；（二）黄灯亮时，已越过停止线的车辆可以继续通行；（三）红灯亮时，禁止车辆通行。在未设置非机动车信号灯和人行横道信号灯的路口，非机动车和行人应当按照机动车信号灯的表示通行。红灯亮时，右转弯的车辆在不妨碍被放行的车辆、行人通行的情况下，可以通行。
- 《道路交通安全违法行为记分管理办法》第十条：驾驶机动车不按交通信号灯指示通行的，一次记6分。
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