进入左转待转区变红灯停下来是否扣分，需结合具体情况判断。以下是对此问题的详细分析：

1. 已越过停止线的情况：

   • 若在左转待转区前方有明确的停止线，且车辆在红灯亮起前已越过停止线，只是在待转区内停车等待，这种情况一般不会扣分。因为此时车辆已经按照交通信号灯的指示，在绿灯时进入了待转区，红灯亮起时只是正常等待信号灯变换，不属于交通违法行为。

2. 未越过停止线的情况：

   • 若车辆未越过停止线就停在左转待转区内，当红灯亮起时，这通常被视为违反交通信号灯指示的行为。根据相关规定，此类行为可能会被记6分并罚款200元。因为车辆未在绿灯时越过停止线进入待转区，而是在红灯时停在待转区内，这违反了交通信号灯的指示。

3. 路口设置或信号控制系统问题：

   • 有些路口的左转待转区设置可能不太规范，或者交通信号控制系统存在问题。在这种情况下，如果车辆因为路口设置或信号控制系统的问题而误停在待转区内，驾驶员可以通过查看路口的监控录像等方式，向交管部门说明情况。交管部门会根据实际情况，确定是否应被扣分和罚款。

4. 地区差异：

   • 各地的交通管理规定可能会有所差异。具体的扣分情况还需依据当地的交通法规和实际执法标准来确定。因此，驾驶员在行驶过程中，应了解并遵守当地的交通管理规定。

法律背景与建议：

• 根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》的相关规定，机动车信号灯表示绿灯亮时准许车辆通行，但转弯的车辆不得妨碍被放行的直行车辆、行人通行；红灯亮时禁止车辆通行。驾驶员在行驶过程中应严格遵守交通信号灯的指示。
• 如果驾驶员对交通信号灯的指示或交通管理规定有疑问，建议提前了解并遵守相关规定，或者在行驶过程中保持谨慎驾驶，避免因为不了解规定而违反交通法规。

可能后果：

• 如果驾驶员因为违反交通信号灯指示而被扣分和罚款，这不仅会影响驾驶员的驾驶记录，还可能对驾驶员的日常生活和工作产生一定影响。因此，驾驶员应严格遵守交通法规，确保行车安全。

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