在处理被代持人退股纠纷时，起诉主体的确定需根据具体情况来分析，一般而言，可能涉及公司和代持人两个主体，但并非一定同时起诉两者。以下从不同角度进行详细分析：
从合同相对性原则出发：
- 如果被代持人与代持人之间签订了明确的股权代持协议，并且该协议中详细规定了退股的条件、程序以及违约责任等，那么在被代持人要求退股而代持人拒绝或无法履行时，被代持人通常可以直接依据该协议起诉代持人，要求其履行退股义务或承担违约责任。
- 在这种情况下，公司可能并非直接的合同当事人，因此不一定成为被告。但是，如果退股涉及公司股权结构的变更，如需要公司办理股权变更登记等手续，那么公司可能作为第三人参与诉讼，或者根据法院的判决或裁定配合办理相关手续。
从公司法规定及股东权益保护角度出发：
- 如果被代持人希望直接通过公司来实现退股，比如要求公司回购其股权或进行股权转让等，那么这通常需要依据公司法的相关规定以及公司章程的约定来操作。
- 在这种情况下，如果公司拒绝或无法满足被代持人的退股请求，被代持人可以考虑将公司作为被告起诉，要求公司承担相应的法律责任。但需要注意的是，这种起诉通常需要满足一定的条件，如公司存在违法行为或违反章程约定等。
- 同时，如果代持人在代持过程中存在过错或违法行为，导致被代持人无法顺利退股，那么被代持人也可以考虑将代持人作为共同被告或第三人一并起诉，以维护自己的合法权益。
从实际纠纷解决效果出发：
- 在某些情况下，同时起诉公司和代持人可能更有利于纠纷的解决。比如，如果代持人没有足够的财产来承担退股责任，而被代持人又希望尽快实现退股并获得相应的补偿，那么同时起诉公司可能有助于迫使公司采取积极措施来解决问题，如协调代持人履行义务或直接进行股权回购等。
- 但是，同时起诉两个主体也可能增加诉讼的复杂性和成本，因此需要被代持人在起诉前进行充分的评估和考虑。
法律建议：
- 在处理被代持人退股纠纷时，建议被代持人首先仔细审查股权代持协议以及公司章程的相关规定，明确自己的权利和义务以及退股的条件和程序。
- 如果与代持人或公司无法协商解决纠纷，建议被代持人及时咨询专业律师，根据具体情况制定合适的诉讼策略，并准备充分的证据材料来支持自己的主张。
- 在起诉过程中，被代持人需要密切关注诉讼的进展和法院的判决或裁定，及时采取必要的措施来维护自己的合法权益。
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