结论：公司员工在休长期病假期间是有工资的，但具体数额会根据职工实际参加工作年限、在本单位工作年限以及相关法律法规的规定而有所差异。

详细分析：

1. 法定医疗期内的工资支付：

   • 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，企业职工因患病或非因工负伤需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，可享受三个月到二十四个月的医疗期。
   • 在法定医疗期内，企业应当支付病假工资或疾病救济费。具体标准为，病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。这里的“当地最低工资标准”是指劳动者在法定工作时间或依法签订的劳动合同约定的工作时间内提供了正常劳动的前提下，用人单位依法应支付的最低劳动报酬。

2. 病假工资的计算方式：

   • 计算基数：劳动合同对月工资有明确约定的，按合同约定确定；实际履行与合同约定不一致的，按实际履行的月工资确定；劳动合同、集体合同均无约定的，按劳动者正常出勤月工资的70%确定（不包括特殊情况下支付的工资）。
   • 计算系数：连续休假6个月以内的，根据连续工龄的不同，病假工资按本人工资的60%至100%计发；连续休假超过6个月的，由企业支付疾病救济费，标准相对较低，按本人工资的40%至60%计发。

3. 超过法定医疗期的处理：

   • 若员工超过法定医疗期仍无法正常工作，且不能从事由用人单位另行安排的工作，用人单位有权解除劳动合同。自解除劳动合同之日起，公司不再支付工资，但需按法律规定支付经济补偿。
   • 在超过法定医疗期后，若用人单位出于人道主义关怀或与员工达成一致，可继续让员工休假并支付一定的生活补助。但这并非法律强制要求，具体支付标准、方式和期限等需由双方协商确定。

4. 地方规定与劳动合同约定：

   • 部分地区可能有更具体的病假工资支付规定或上限要求，因此在具体操作时还需参考当地的相关政策文件。
   • 如果员工和用人单位在劳动合同中有关于病假工资的特别约定，且该约定不违反法律法规强制性规定，那么就按照约定执行。但无论如何，都不能低于法定最低标准（即最低工资标准的80%）。

举例说明：

假设小张在A公司工作了3年，实际工作年限为5年。根据规定，他患病后可享受3个月的医疗期。在这3个月内，A公司支付给他的病假工资不能低于当地最低工资标准的80%。若3个月医疗期满后，小张仍不能工作，且无法从事A公司另行安排的工作，A公司在支付相应经济补偿后，有权解除与他的劳动合同，此后便无需再支付工资。但若A公司出于人道考虑，与小张协商一致后决定继续支付其一定的生活补助，这也是可以的，但具体支付标准等需由双方协商确定。

建议与提醒：

• 员工在请病假时，应如实禀告病情，并遵循单位的请假流程，提供必要的医疗证明。
• 用人单位应遵守相关法律法规，按时足额支付员工的病假工资或疾病救济费。
• 若双方在病假工资支付问题上产生争议，可通过协商、投诉举报或申请劳动仲裁等方式解决。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。