结论：开给别人的转账支票作废时，对方一般没有法律义务必须将存根联返还给你们，但基于实务操作和双方合作关系的考量，可与对方友好协商要求返还。以下从法律和实务两个角度为你详细分析：

法律角度

• 存根联的性质与归属：转账支票的存根联是出票人（即你们）在开具支票时留存的凭证，其作用主要是用于出票人自身记账、核对交易等内部财务管理工作。从法律意义上讲，存根联的所有权归属于出票人，也就是你们公司。
• 对方无强制返还义务：当支票作废后，对方并没有法律上的强制义务要将存根联返还给你们。因为存根联本身并不直接影响支票作废的法律效力以及双方之间的债权债务关系。支票作废主要是通过银行的相关操作和手续来完成的，例如出票人办理挂失止付、向银行申请作废等，只要完成了这些法定程序，支票就会失去效力，与对方是否返还存根联没有必然联系。

实务角度

• 便于内部管理：虽然法律上对方没有返还存根联的义务，但从你们公司内部财务管理的角度来看，收回存根联有助于你们更准确地记录财务收支情况，核对每一笔交易的详细信息，保证财务账目的清晰和准确。如果存根联留在对方手中，可能会给你们后续的财务核对和审计工作带来一定的不便。
• 友好协商解决：基于上述情况，建议你们与对方进行友好协商，向对方说明存根联对你们公司财务管理的重要性，争取对方的理解和配合，将存根联返还给你们。在协商过程中，要注意方式方法，避免因为此事影响双方之间的合作关系。如果对方同意返还，最好能签订一个简单的书面协议，明确返还的时间、方式等事项，以避免后续可能出现的纠纷。

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