若剪辑师在公司上班时使用了侵权素材，可能面临民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任，具体后果取决于侵权行为的性质、后果及主观过错程度，公司也可能因未尽到合理审查义务而承担连带责任。 以下从不同角度展开分析：
一、剪辑师的法律责任
民事责任：
- 赔偿损失：根据《中华人民共和国著作权法》第五十四条，若剪辑师未经著作权人许可使用其作品，构成侵权的，应当根据情况承担停止侵害、消除影响、赔礼道歉、赔偿损失等民事责任。赔偿数额通常按照权利人因此受到的实际损失或侵权人的违法所得给予赔偿，难以计算的，可参照权利使用费给予赔偿。
- 合理费用：权利人为制止侵权行为所支付的合理开支，如律师费、公证费等，也应由侵权人承担。
行政责任：
- 警告、罚款：根据《中华人民共和国著作权法》第五十三条，若侵权行为同时损害公共利益的，可由主管著作权的部门责令停止侵权行为，予以警告，没收违法所得，没收、无害化销毁处理侵权复制品以及主要用于制作侵权复制品的材料、工具、设备等，违法经营额五万元以上的，可并处违法经营额一倍以上五倍以下的罚款；没有违法经营额、违法经营额难以计算或者不足五万元的，可并处二十五万元以下的罚款。
刑事责任：
- 刑事处罚：若侵权行为构成犯罪的，如以营利为目的，未经著作权人许可，复制发行、通过信息网络向公众传播其文字作品、音乐、美术、视听作品、计算机软件及法律、行政法规规定的其他作品，违法所得数额较大或者有其他严重情节的，根据《中华人民共和国刑法》第二百一十七条，可处三年以下有期徒刑，并处或者单处罚金；违法所得数额巨大或者有其他特别严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
二、公司的法律责任
连带责任：
- 未尽审查义务：若公司作为剪辑师的工作单位，未尽到合理审查义务，如未对剪辑师使用的素材进行版权审核，导致侵权行为发生的，公司可能因共同侵权或帮助侵权而承担连带责任。
内部管理责任：
- 规章制度：公司应建立健全内部管理制度，明确素材使用的版权要求，加强对剪辑师的培训和教育，防止侵权行为的发生。若公司因管理不善导致侵权行为频发，可能面临行政监管部门的处罚或声誉损失。
三、应对措施与建议
立即停止侵权：
- 下架作品：一旦发现使用侵权素材，剪辑师和公司应立即停止侵权行为，下架相关作品，防止侵权后果的进一步扩大。
积极沟通协商：
- 赔偿协商：与著作权人积极沟通协商，寻求和解或达成赔偿协议，以减少法律纠纷和损失。
加强版权审核：
- 建立审核机制：公司应建立严格的素材版权审核机制，确保剪辑师使用的素材均获得合法授权或属于合理使用范畴。
寻求法律帮助：
- 专业咨询：在面临复杂的版权纠纷时，建议及时咨询专业律师，了解自身权利义务和法律风险，制定合理的应对策略。