结论：请假两天后第三天上班是否合法，这主要取决于请假的原因、公司的规章制度以及相关法律法规的规定。以下从不同角度进行分析：

1. 从公司规章制度的角度：

   • 如果公司的规章制度中明确规定了请假的流程、期限以及请假后的复工要求，并且员工在请假时已经按照这些规定进行了申请和批准，那么员工在请假两天后第三天上班是符合公司规定的，因此是合法的。
   • 如果员工没有按照公司规章制度进行请假，或者请假未获批准就擅自离岗，那么即使第三天回来上班，也可能因为违反公司规定而面临相应的纪律处分。

2. 从法律法规的角度：

   • 在一般情况下，法律法规并不会直接规定员工请假两天后第三天上班是否合法，因为这更多属于公司内部管理范畴。但是，如果员工的请假是因为生病、工伤等法定事由，并且已经按照法律规定进行了医疗期、停工留薪期等的申请和批准，那么员工在请假期限结束后回来上班是合法的。
   • 如果员工请假是因为非法定事由，且公司规章制度对此没有明确规定，那么员工请假两天后第三天上班是否合法，就需要根据具体情况来判断，比如是否影响了公司的正常运营、是否得到了公司的同意等。

3. 特殊情况下的考虑：

   • 如果员工在请假期间发生了特殊情况，比如突发疾病需要延长医疗期，或者家庭突发变故需要额外请假等，员工应及时与公司沟通并说明情况，按照公司规定或法律法规进行申请和批准。在这种情况下，员工请假期限的延长和后续的复工安排，需要得到公司的理解和支持。
   • 另外，如果员工请假是因为参加社会活动、履行公民义务等法定事由，且已经按照法律规定进行了申请和批准，那么员工在请假期限结束后回来上班也是合法的。

建议：

• 作为员工，在请假前应仔细阅读公司的规章制度，了解请假的流程、期限以及复工要求，确保自己的请假行为符合公司规定。
• 如果因为特殊情况需要延长请假期限或提前复工，应及时与公司沟通并说明情况，按照公司规定或法律法规进行申请和批准。
• 作为公司，应制定完善的规章制度，明确请假的流程、期限以及复工要求，保障员工的合法权益，同时也维护公司的正常运营秩序。

如果有任何具体的法律问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。