结论：针对三调地类为宅基地但违法占用修建建筑物的情况，主要适用的法律条款包括《土地管理法》中的相关规定，特别是第七十七条和第七十八条，具体适用哪一条需根据违法主体的不同来区分。

详细分析：

1. 法律条款适用：

   • 《土地管理法》第七十七条：此条款主要针对未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的行为。若宅基地被违法占用修建建筑物，且该行为未经相关部门批准或存在欺骗手段，则可依据此条款进行处罚。处罚措施通常包括责令退还非法占用的土地、限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施、恢复土地原状，并可能处以罚款。
   • 《土地管理法》第七十八条：此条款专门针对农村村民未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地建住宅的行为。若违法占用宅基地修建建筑物的主体是农村村民，且该行为未经批准或存在欺骗手段，则应优先适用此条款。处罚措施与第七十七条类似，但更侧重于对农村村民非法建住宅行为的规范。

2. 违法主体区分：

   • 在实际应用中，关键在于区分违法占用的主体。如果是非农村村民（如城镇居民、企业等）违法占用宅基地修建建筑物，则应适用第七十七条；如果是农村村民违法占用宅基地修建住宅，则应适用第七十八条。

3. 法律后果与程序：

   • 无论适用哪一条款，违法者都可能面临责令退还土地、限期拆除建筑物、恢复土地原状以及罚款等处罚。
   • 在处理此类案件时，相关部门（如自然资源主管部门）会依法进行调查取证，确认违法事实后作出行政处罚决定。违法者若对处罚决定不服，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。

4. 实际操作建议：

   • 对于违法占用宅基地修建建筑物的行为，建议相关部门及时介入调查，依法作出处理决定，以维护土地管理秩序和宅基地的合理利用。
   • 对于违法者而言，应认识到违法行为的严重性，积极配合相关部门的调查和处理工作，尽快纠正违法行为，以减少损失和法律后果。

进一步思考：

• 在处理此类案件时，还需考虑宅基地的权属问题、违法占用的时间长度、建筑物的规模等因素，这些因素可能影响处罚的力度和方式。
• 此外，随着法律法规的不断完善和土地管理政策的调整，未来在处理类似案件时可能会有新的规定和要求，因此需保持对法律法规的持续关注和学习。

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