行政规范性文件备案不通过的，原则上自始不发生效力，但存在例外情形。具体分析如下：

1. 备案不通过的一般后果：自始无效
   根据《国务院办公厅关于加强行政规范性文件制定和监督管理工作的通知》（国办发〔2018〕37号）及地方性法规（如《江苏省行政规范性文件管理规定》），行政规范性文件需经备案审查机关合法性审核后才能生效。若备案审查机关认为文件存在超越法定权限、违反法定程序、内容违法等情形，会作出“不予备案”决定，此时文件自制定之日起即无效，不得作为行政管理的依据。
   例如：某市政府制定的规范性文件未经过公开征求意见程序，备案时被省司法厅驳回，该文件自始不能对外产生法律效力。

2. 例外情形：补正后重新备案
   若备案不通过的原因是程序瑕疵（如未附制定说明、未公开征求意见等），而非内容违法，制定机关可在补正程序后重新报备。经审查通过的，文件效力可追溯至原发布日期（部分地方规定如此，需结合具体法规判断）。
   例如：某县文件因未附制定依据被退回，补充材料后重新备案通过，其效力可自首次发布时起算。

3. 备案不通过的后续处理

   • 制定机关义务：需立即停止执行该文件，并向社会公告失效；若已造成损失，可能面临行政复议或诉讼中的违法确认风险。
     
   • 监督机关责任：备案审查机关（如司法局）需将不予备案决定抄送制定机关的上级部门，并纳入法治政府考核，形成监督闭环。

建议：若您遇到规范性文件备案问题，需结合文件内容、制定程序及地方具体规定综合判断效力。如有具体文件或案例，可进一步向我咨询，我会结合法规细节为您分析。