行政处罚做出三年后，在特定条件下仍然可以主动撤销。以下是对此问题的详细分析：
一、行政处罚的撤销途径
行政机关主动撤销：
- 行政机关在发现行政处罚决定存在违法、不合理，或事实认定错误、证据不足、适用法律错误、程序违法等情形时，有权主动撤销该处罚决定。这一撤销权并不受时间限制，即使行政处罚已经做出三年，只要发现存在错误，行政机关仍应主动纠正。
通过行政复议申请撤销：
- 当事人若认为行政处罚存在错误或不公正，可以在知道具体行政行为之日起六十日内申请行政复议。
- 行政复议机关在受理复议申请后，一般会在六十日内作出复议决定（特殊情况可适当延长）。
- 如果复议机关认为行政处罚存在错误或不当，可决定撤销。但需注意，若当事人在行政处罚做出三年后才申请行政复议，可能因超过法定申请期限而面临复议机关不予受理的风险，除非存在法定延长事由。
通过行政诉讼申请撤销：
- 当事人若认为行政处罚侵犯其合法权益，可以在知道或者应当知道作出行政行为之日起六个月内提起行政诉讼。
- 法院经过审理，若认定行政处罚存在违法情形，可作出撤销判决。
- 同样，若当事人在行政处罚做出三年后才提起行政诉讼，也可能因超过法定起诉期限而面临法院不予受理的风险，除非存在法定延长事由（如不可抗力或其他正当理由耽误起诉期限）。
二、行政处罚的撤销条件
行政处罚的撤销通常基于以下条件：
行政行为合法要件缺损：
- 合法的行政行为必须具备主体合法、内容合法、程序合法三要素。
- 若行政处罚决定在这些方面存在缺陷（如主要事实不清、证据不足、适用依据错误、违反法定程序等），则该行政处罚可撤销。
行政行为不适当：
- 包括行政行为不合理、不公正、不符合现行政策、不合时宜、不符合善良风俗等情形。
- 若行政处罚被认定为不适当，同样可被撤销。
三、特殊情况下的撤销
- 在特殊情况下，如行政机关未履行好告知义务导致当事人不知道处罚决定，或当事人因不可抗力等原因未能在规定时间内申请复议或提起诉讼，当事人可申请行政机关重新审查并决定是否撤销行政处罚。
- 但这种情况必须符合法定条件，并经过法定程序。例如，当事人需提供充分证据证明其因不可抗力或其他正当理由耽误了申请复议或提起诉讼的期限。
四、法律建议
及时行使救济权利：
- 当事人若认为行政处罚存在错误或不公正，应及时通过合法途径（如行政复议或行政诉讼）申请撤销，以免因超过法定时效而丧失救济机会。
收集并保留证据：
- 在申请撤销行政处罚时，当事人应收集并保留相关证据（如行政处罚决定书、相关证据材料等），以证明行政处罚存在错误或不公正之处。
咨询专业律师：
- 由于行政处罚的撤销涉及复杂的法律程序和实体问题，当事人可咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。作为成忠昇律师，我擅长处理刑事辩护、行政纠纷、合同纠纷、经济纠纷等领域的问题，你可以直接向我咨询。
综上所述，行政处罚做出三年后，在特定条件下仍然可以主动撤销。但当事人需及时行使救济权利，并收集并保留相关证据以支持其撤销申请。