结论：自然资源部查处违法用地并认定违法后，若该违法行为给您造成了损失，且符合行政赔偿的法定条件，您是可以向法院起诉请求行政赔偿的。
分析说明：
行政赔偿的法律依据：
- 根据《中华人民共和国国家赔偿法》的相关规定，行政机关及其工作人员在行使行政职权时，有侵犯公民、法人和其他组织合法权益的情形，造成损害的，受害人有依照本法取得国家赔偿的权利。这包括违法实施罚款、吊销许可证和执照、责令停产停业、没收财物等行政处罚，以及违法对财产采取查封、扣押、冻结等行政强制措施等情形。
自然资源部查处违法用地的性质：
- 自然资源部作为行政机关，在查处违法用地行为时，是在行使其行政职权。如果其查处行为被认定为违法，且该行为给您造成了损失，那么您就有权依据国家赔偿法的规定，请求行政赔偿。
起诉行政赔偿的条件：
- 要起诉行政赔偿，您需要证明自然资源部的查处行为违法，并且该行为与您所遭受的损失之间存在因果关系。这通常需要通过行政诉讼程序来确认。在行政诉讼中，法院会审查自然资源部的查处行为是否合法，以及该行为是否给您造成了损失。
起诉行政赔偿的流程：
- 您需要先向自然资源部提出行政赔偿请求，如果自然资源部在规定期限内未作出赔偿决定，或者您对赔偿决定不满意，那么您可以向法院提起行政赔偿诉讼。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据来证明您的损失以及该损失与自然资源部查处行为之间的因果关系。
行动建议：
- 如果您认为自然资源部的查处行为给您造成了损失，并且该行为被认定为违法，那么您可以先尝试与自然资源部协商解决赔偿问题。
- 如果协商无果，或者您对自然资源部的赔偿决定不满意，那么您可以向法院提起行政赔偿诉讼。在诉讼过程中，建议您寻求专业律师的帮助，以便更好地维护您的合法权益。
法律后果：
- 如果法院最终认定自然资源部的查处行为违法，并且该行为给您造成了损失，那么法院将会判决自然资源部承担相应的赔偿责任。
- 如果法院认为您的赔偿请求不成立，或者您提供的证据不足以证明您的损失以及该损失与自然资源部查处行为之间的因果关系，那么您的赔偿请求可能会被驳回。
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