在有合同、发票以及发放工资流水的情况下起诉，通常是有效的，但具体还需结合案件类型和诉求综合判断。以下分情况详细说明：

1. 如果是劳动争议案件：

   • 合同（劳动合同）是证明劳动关系存在的核心证据，能明确双方的权利义务关系；
   • 工资流水是证明用人单位实际支付劳动报酬的关键证据，可印证劳动合同中关于薪资的约定；
   • 发票若与工作相关（如报销凭证），可辅助证明劳动者履行了工作职责或存在相关费用支出。
   • 综合效力：这三类证据组合使用，能形成完整的证据链，有效支持劳动者主张工资、加班费、经济补偿等诉求。但需注意，劳动争议需先申请劳动仲裁，对仲裁结果不服才能起诉至法院。

2. 如果是普通民事合同纠纷（如劳务合同、承揽合同等）：

   • 合同是约定双方权利义务的基础文件，直接决定案件的法律关系性质；
   • 工资流水（或转账记录）可证明一方已履行付款义务，或对方未履行对应义务（如未提供劳务）；
   • 发票若为对方要求开具，可证明交易的真实性及金额，辅助证明合同履行情况。
   • 综合效力：若起诉目的是追讨欠款或主张违约责任，这三类证据能有力支持诉求。但需结合合同具体条款（如付款条件、违约责任等）进一步分析。

3. 需补充的关键点：

   • 证据完整性：仅有这三类证据可能不够，还需结合其他证据（如工作记录、沟通记录等）证明具体诉求（如工作量、违约事实等）；
   • 证据合法性：需确保合同、流水、发票的真实性、合法性（如合同非伪造、流水非虚假等），否则可能被法院排除；
   • 诉讼时效：需在法定时效内起诉（如劳动争议一般为1年，普通民事纠纷为3年），否则可能丧失胜诉权。

建议：若您已具备这些证据，可进一步整理证据清单，明确起诉对象、诉求及事实理由，并咨询我具体案件细节，以便更精准地分析案件走向。