刑期三年的案件，在符合特定条件下，是可以进行封存的。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律依据与封存条件
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百八十六条的规定，犯罪的时候不满十八周岁，被判处五年有期徒刑以下刑罚的，应当对相关犯罪记录予以封存。这一条款明确指出了封存的条件：一是犯罪时不满十八周岁，二是被判处的刑罚为五年有期徒刑以下。因此，对于刑期三年的案件，如果犯罪时行为人未满十八周岁，那么该案件的犯罪记录应当被封存。
二、封存的意义与效果
犯罪记录封存制度的主要目的在于保护未成年人的隐私和名誉，促进其顺利回归社会。封存后，犯罪记录不对外公开，司法机关为办案需要或者有关单位根据国家规定进行查询的除外。依法进行查询的单位，应当对被封存的犯罪记录的情况予以保密。这意味着，封存后的犯罪记录在一般情况下不会对行为人的生活、工作和学习产生负面影响。
三、特殊情况与注意事项
成年后犯罪：如果行为人在犯罪时已满十八周岁，即使被判处的刑罚为三年有期徒刑，其犯罪记录也不会被封存。这是因为封存制度主要针对的是未成年人犯罪。
查询与解封：虽然犯罪记录被封存，但在特定情况下，如司法机关为办案需要或有关单位根据国家规定进行查询时，仍可以依法查询。此外，如果行为人再次犯罪且可能判处五年有期徒刑以上刑罚的，司法机关在办理案件时也可以查询其之前的犯罪记录。
封存后的影响：封存并不意味着犯罪记录完全消失。在特定情况下，如行为人申请出国、报考公务员等需要无犯罪记录证明时，仍可能因之前的犯罪记录而受到影响。但这种情况相对较少，且具体影响需根据相关规定和实际情况进行判断。
四、建议与行动
了解封存程序：如果符合封存条件，行为人或其家属可以向相关司法机关了解封存的具体程序和要求，以便及时办理封存手续。
咨询专业律师：在处理涉及犯罪记录封存的问题时，建议咨询专业律师以获取更详细、更准确的法律意见和帮助。虽然我在此已给出了一般性的分析，但具体案件仍需根据实际情况进行判断和处理。
遵守法律法规：无论犯罪记录是否被封存，行为人都应遵守法律法规，不再犯罪。这是维护个人名誉和社会秩序的基本要求。