合伙决议被法院判决无效后，登记机关撤销相关登记的流程主要依据相关法律法规及行政程序进行，以下是对此问题的详细解答：

1. 法院判决无效的法律基础：

   • 当合伙决议因违反法律法规、合伙协议或存在其他法定无效情形时，法院会依法判决该决议无效。这一判决是登记机关撤销相关登记的前提和依据。

2. 登记机关撤销登记的法律依据：

   • 根据《中华人民共和国市场主体登记管理条例》等相关法律法规，市场主体（包括合伙企业）的登记事项应当真实、准确、完整。当登记事项因合伙决议无效而发生变化时，登记机关有权根据法院判决或行政决定撤销或变更相关登记。

3. 撤销登记的具体流程：

   • 提交申请：通常，需要由合伙企业或相关利害关系人（如合伙人、债权人等）向登记机关提交撤销登记的申请，并附上法院判决无效的文书作为证据。
   • 审查材料：登记机关在收到申请后，会审查提交的材料是否齐全、有效，特别是法院判决文书是否真实、合法。
   • 作出决定：经审查认为符合撤销登记条件的，登记机关会作出撤销登记的决定，并通知申请人。同时，登记机关会在其登记系统中对相关登记信息进行变更或注销。
   • 公告与备案：根据需要，登记机关可能会对撤销登记的决定进行公告，并将相关情况备案存档。

4. 注意事项：

   • 时效性：合伙企业或相关利害关系人应在法院判决生效后及时向登记机关申请撤销登记，以免因拖延而产生不必要的法律风险。
   • 证据充分性：在提交申请时，应确保提供的证据（如法院判决文书）充分、有效，能够证明合伙决议无效的事实。
   • 配合登记机关工作：在撤销登记过程中，应积极配合登记机关的工作，按照要求提供必要的材料和信息。

5. 可能遇到的法律后果：

   • 如果合伙决议被法院判决无效后，未及时向登记机关申请撤销相关登记，可能会导致合伙企业的登记事项与实际情况不符，进而引发一系列法律风险，如被行政处罚、承担民事责任等。
   • 同时，如果登记机关在撤销登记过程中存在违法行为或不当行为，相关利害关系人也有权依法寻求救济，如提起行政诉讼等。

总结来说，合伙决议被法院判决无效后，登记机关会根据相关法律法规和行政程序撤销相关登记。合伙企业或相关利害关系人应及时向登记机关提交申请，并附上法院判决无效的文书作为证据。在撤销登记过程中，应积极配合登记机关的工作，并注意时效性和证据充分性等问题。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。