合同盖二级单位的章是否有效，需视具体情况而定。以下是对此问题的详细分析：
一、二级单位印章的法律效力基础
印章的代表权：二级单位作为公司的一个分支机构或部门，其印章的法律效力取决于该单位是否被授权使用印章并代表公司签订合同。如果二级单位获得了公司的明确授权，那么其印章在合同上使用是具有法律效力的。
合同成立的要件：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。因此，只要合同上的印章是真实有效的，且能够代表相应的权利主体，那么该印章就具有法律效力。
二、二级单位印章有效的条件
印章的真实性：合同上所盖的二级单位印章必须是真实有效的，不能是伪造或变造的。如果印章是伪造的，那么整个合同的效力可能会受到影响，甚至可能导致合同无效。
授权范围：二级单位必须在公司授权的范围内使用印章并签订合同。如果二级单位超越了公司的授权范围，那么其签订的合同可能对公司不产生法律效力，除非公司事后追认。
不违反法律法规：合同的内容和盖章行为都不能违反法律法规的强制性规定。如果合同内容违法或盖章行为存在欺诈、胁迫等情形，那么合同的效力可能会被否定。
三、特殊情况下的有效性分析
二级单位具有独立法人资格：如果二级单位是具有独立法人资格的子公司，那么其印章在合同上使用是具有完全法律效力的，因为子公司可以独立承担民事责任。
内部审批流程：在某些情况下，公司可能要求合同必须经过多个部门的审批并加盖相应的印章才能生效。如果二级单位是合同审批流程中的一个环节，并且其印章是审批流程中必需的，那么在该流程完成后，合同是有效的。
四、法律建议
核实印章的真实性：在签订合同前，务必核实二级单位印章的真实性，可以通过向公司总部或相关部门查询确认。
明确授权范围：要求二级单位提供公司对其的授权文件或证明，明确其签订合同的权限范围。
审查合同内容：仔细审查合同内容，确保合同不违反法律法规的强制性规定，并且符合双方的利益和需求。
保留证据：在签订合同过程中，保留好所有相关的证据和文件，如授权文件、审批流程记录等，以备不时之需。
如果您在合同签订过程中遇到任何疑问或问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议和帮助。