乙方是有权起诉甲方的，但能否胜诉需视具体情况而定。以下从不同角度为您详细分析：
一、合同效力角度
合同成立与生效：
- 甲乙双方20多年前签订的房屋买卖协议，如果双方意思表示真实，且不存在欺诈、胁迫等情形，该合同自成立时即生效。
- 农村房屋买卖合同，虽涉及宅基地使用权转让，但根据相关法律规定及司法实践，非同一集体经济组织成员之间的房屋买卖合同，并不当然无效。如果买卖行为已经得到集体经济组织的认可，或者买方在购买后已经实际居住并管理房屋多年，且未受到集体经济组织的反对，那么该合同可能被认定为有效。
合同履行情况：
- 如果合同已经实际履行，即乙方已经支付房款，甲方已经交付房屋，且乙方已经实际居住多年，那么合同的履行情况将作为判断合同效力及双方权利义务的重要依据。
二、诉讼时效角度
诉讼时效期间：
- 根据《中华人民共和国民法典》的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
- 在您的情况下，虽然房屋买卖已经过去20多年，但如果乙方能够证明其一直在主张权利，或者存在其他导致诉讼时效中断、中止的情形，那么诉讼时效可能并未过期。
诉讼时效抗辩：
- 如果甲方提出诉讼时效抗辩，且乙方无法证明诉讼时效存在中断、中止的情形，那么乙方可能面临败诉的风险。但是，诉讼时效的抗辩需要由甲方主动提出，如果甲方未提出，法院不会主动适用诉讼时效的规定。
三、法律建议
收集证据：
- 乙方应尽快收集与房屋买卖相关的所有证据，包括合同、付款凭证、房屋交付证明、实际居住证明等，以证明合同的成立、履行及自己的权利。
咨询专业律师：
- 由于农村房屋买卖涉及的法律问题较为复杂，且不同地区的司法实践可能存在差异，因此乙方应咨询专业律师，了解当地的具体法律规定和司法实践，以便更好地维护自己的权益。
考虑和解或调解：
- 在诉讼之前，乙方也可以考虑与甲方进行和解或调解，以达成双方都能接受的解决方案，避免不必要的法律纠纷和诉讼成本。
提起诉讼：
- 如果和解或调解无果，乙方可以向人民法院提起诉讼，要求确认合同效力、继续履行合同或赔偿损失等。在诉讼过程中，乙方应积极配合法院的工作，提供必要的证据和材料，以支持自己的诉讼请求。