关于您提出的“在十字路口绿灯突变红灯车辆过了停止线但是停下来了是否扣分罚款”的问题，这确实是一个需要细致分析的情况。以下是我根据相关交通法规和常见实践，为您提供的详细解答：
一、不扣分或罚款较轻的情况
及时停车且未妨碍交通：
- 如果您的车辆在绿灯即将结束或刚变红灯时，只是刚刚越过停止线，但立即停住了，并且没有继续行驶或妨碍其他车辆和行人的正常通行，那么根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》的相关规定，您通常不会被扣分。不过，交警可能会根据具体情况，给予您二十元以上二百元以下的罚款，这主要是作为一种轻微的交通违规警告。
因特殊情况紧急停车：
- 如果您是因为刹车不及时或其他紧急情况（如避让突然出现的行人或障碍物）而不得不越过停止线停车，且您能提供充分的证据证明这一点，那么交警在核实情况后，通常也不会对您进行扣分或罚款。
二、可能扣分或罚款较重的情况
越线后停车位置不当：
- 如果您的车辆越过停止线后停车，且停车位置不当，比如停在了人行横道上或影响了其他车辆的正常转弯等，那么交警可能会按照不按规定行车或停车进行处罚。这种情况下，您可能会面临扣2分，并罚款20元以上200元以下的处罚。
被误判为闯红灯：
- 闯红灯的判定通常需要电子眼抓拍到三张照片：车辆驶过停止线、全车超过停止线、车辆经过路口。如果您的车辆在越过停止线后，由于某种原因（如电子眼抓拍角度、光线等因素）被误判为继续行驶并完全通过了路口，那么您可能会被认定为闯红灯，从而面临扣6分并罚款200元的处罚。不过，这种情况相对较少，且如果您对处罚有异议，可以申请行政复议或提起行政诉讼来维护自己的权益。
三、建议与总结
- 严格遵守交通规则：为了避免不必要的处罚和安全隐患，我建议您在驾驶过程中严格遵守交通规则，特别是在接近路口时要注意观察交通信号灯的变化，提前做好减速或停车的准备。
- 保持冷静与谨慎：如果遇到绿灯即将结束或刚变红灯的情况，不要慌张或急于通过路口，而是应该保持冷静并谨慎停车，确保自己和他人的安全。
- 了解当地交通法规：不同地区的交通法规可能会有所差异，因此我建议您在驾驶前了解并遵守当地的交通法规和规定，以避免因不了解规定而导致的违规行为。
综上所述，您在十字路口绿灯突变红灯时车辆过了停止线但是停下来了是否扣分罚款，取决于您的具体行为以及是否妨碍了其他交通参与者的正常通行。为了确保自己的行车安全和避免不必要的处罚，我建议您严格遵守交通规则并保持谨慎驾驶。