红绿灯变红了在路口停住了，一般情况下不会扣分，但具体还需根据停车的位置和情况来判断。以下是对此问题的详细分析：

1. 正常停车等待绿灯：

   • 如果在红绿灯路口遇到红灯，驾驶员按照交通规则在停止线以内依次排队停车等待绿灯亮起，这种属于正常遵守交通规则的停车行为，不会扣分。这是最常见的停车情况，也是驾驶员应遵守的基本交通规则。

2. 违规停车情况：

   • 压实线停车：若停车时车身压到路口的实线（如白色实线或黄色实线），这种行为违反了禁止标线指示。根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，通常会被扣1分，并可能伴随罚款。因此，驾驶员在停车时需确保车身完全停在停止线以内，避免压实线。
   • 在网状线区域停车：路口设有的黄色网状线是禁止以任何原因停车的区域。若在该区域停车，一般会被认定为违反禁止标线指示，扣1分；在某些地区，可能按违反禁令标志指示处理，扣3分，并处罚款。驾驶员应特别注意网状线区域，避免在此停车。
   • 停在禁停区域：根据《中华人民共和国道路交通安全法》及其实施条例，在设有禁停标志、标线的路段，或者在交叉路口、铁路道口、急弯路、宽度不足4米的窄路、桥梁、陡坡、隧道以及距离上述地点50米以内的路段停车，都属于违法行为。在这些区域停车，通常会被扣2分，并处以相应的罚款。驾驶员应了解并遵守禁停区域的规定，避免在此停车。

3. 特殊情况下的处理：

   • 若因前方交通拥堵、有障碍物、被其他车辆逼迫或红灯亮起前已进入路口等特殊情况，导致车辆不得不在红灯时停在路口中间（但未压实线或进入禁停区域），这种情形通常不被视为驾驶人主观故意违反交通规则。在有证据证明或经过申诉核实后，这类特殊情况一般不会被认定为违法行为并扣分罚款。然而，驾驶员应尽快根据路况和信号灯指示驶离路口，以免造成交通拥堵或引发交通事故。

建议：

• 驾驶员在行驶过程中应严格遵守交通规则，特别是在红绿灯路口等关键位置，应确保停车位置合法且不影响其他车辆和行人通行。
• 如果对具体的交通法规或扣分标准有疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律解释和建议。

总之，红绿灯变红了在路口停住了是否扣分，取决于停车的位置和情况。驾驶员应充分了解并遵守相关规定，以确保行车安全并避免不必要的法律后果。