关于停工留薪期工资是否要算加班工资的问题，这是一个涉及法律法规、劳动合同约定以及地方政策等多方面的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：

一、基本法规依据

根据《工伤保险条例》第三十三条的规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这里的“原工资福利待遇”是核心争议点，它通常指的是职工在正常工作状态下的应得工资。

二、“原工资福利待遇”的解读

1. 一般情况：在大多数情况下，“原工资福利待遇”被理解为职工在正常出勤情况下，用人单位按照劳动合同约定或相关规章制度支付给职工的全部工资收入，这通常包括基本工资、奖金、津贴、补贴等。但重要的是，它主要指的是正常工作时间的工资，并不包括加班费。加班费是劳动者在正常工作时间之外额外付出劳动所获得的报酬，具有不确定性和临时性。

2. 特定情况：然而，也存在一些特定情况。在某些地区或特定情境下，如劳动合同有明确约定或地方规定有特别要求，停工留薪期的工资计算可能会包含加班费。这主要是为了确保职工在工伤治疗期间能够维持原有的收入水平，减轻其经济负担。

三、停工留薪期的性质与加班费

停工留薪期是职工治疗工伤的特殊时期，其主要目的是让受伤职工能够安心接受治疗，恢复身体健康。在这个期间，职工并没有实际从事原来的工作，也就不存在加班的情况。因此，从性质上来说，停工留薪期工资不应包含加班费。

四、实际操作建议

1. 参考当地法律法规：在处理此类问题时，应首先参考当地的法律法规和具体政策，了解是否有关于停工留薪期工资计算的明确规定。

2. 审查劳动合同：同时，审查劳动合同中的相关条款，看是否有关于停工留薪期工资计算方式的特别约定。

3. 咨询专业意见：如果存在疑问或争议，建议及时咨询专业律师或相关法律机构，以获取准确的法律意见和指导。

五、结论

综上所述，停工留薪期工资的计算通常不包括加班费。但具体是否扣除需根据当地法律法规、劳动合同的具体约定以及工伤认定机构的意见来确定。在处理此类问题时，应综合考虑多方面因素，确保职工的合法权益得到妥善保障。