在登记机关和确权部门谁是适格被告主体的问题上，需根据具体案件情况和相关法律规定进行综合判断，无法一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 登记机关作为被告的情况：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国行政诉讼法》及相关司法解释，如果登记机关在登记过程中存在违法行为，如错误登记、未依法履行登记职责等，导致公民、法人或其他组织合法权益受损的，登记机关可能成为适格被告。
   • 具体情形：例如，在不动产登记中，如果登记机关因疏忽或故意将不动产权利错误登记在他人名下，导致原权利人利益受损，原权利人可以依法提起行政诉讼，将登记机关作为被告。

2. 确权部门作为被告的情况：

   • 法律依据：确权部门通常负责确认权利归属，如土地确权、房产确权等。如果确权部门在确权过程中存在违法行为，如错误确权、未依法履行确权职责等，导致相关权利人利益受损的，确权部门可能成为适格被告。
   • 具体情形：例如，在土地确权纠纷中，如果确权部门未依法进行调查、核实，错误地将土地确权给非权利人，导致原土地权利人利益受损，原土地权利人可以依法提起行政诉讼，将确权部门作为被告。

3. 登记机关与确权部门共同作为被告的情况：

   • 法律依据：在某些情况下，登记机关和确权部门可能共同参与某一权利确认或登记过程，且均存在违法行为，导致公民、法人或其他组织合法权益受损的。此时，两者可能共同成为适格被告。
   • 具体情形：例如，在房产登记与确权过程中，如果登记机关和确权部门均存在疏忽或故意行为，导致房产权利错误登记或确权，给相关权利人造成损失的，相关权利人可以依法提起行政诉讼，将登记机关和确权部门共同作为被告。

法律建议：

• 在确定适格被告主体时，应首先审查相关登记或确权行为的合法性，以及是否存在违法行为导致权益受损的情况。
• 根据具体案件情况，结合相关法律规定和司法解释，综合判断登记机关或确权部门是否应成为适格被告。
• 如果对适格被告主体存在疑问或争议，建议及时咨询专业律师，以便更准确地把握案件走向和维权策略。

可能法律后果：

• 如果错误地将非适格主体作为被告提起诉讼，可能导致案件被驳回或败诉，浪费诉讼资源和时间。
• 如果遗漏适格被告主体，可能导致案件无法全面解决争议，影响权益保护效果。

综上所述，在登记机关和确权部门谁是适格被告主体的问题上，需根据具体案件情况和相关法律规定进行综合判断。如有疑问或需要进一步法律帮助，请直接向我咨询。