针对农村国家土地超占的问题，这是一个涉及土地管理和法律法规的复杂议题，需要综合考虑历史原因、现实情况以及具体的法律规定来处理。以下是我为您提供的详细解答：
一、明确超占性质与法律依据
首先，我们需要明确什么是宅基地超占。宅基地超占指的是农户实际占用的宅基地面积超过了当地规定的标准。根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，农村村民一户只能拥有一处宅基地，且面积不得超过省、自治区、直辖市规定的标准。超占行为违反了这一法律规定，因此可能面临行政处罚或强制整改。
二、分类处理超占问题
历史遗留问题导致的超占：
- 如果超占行为发生在相关法律法规实施之前，并且符合当时的政策，那么可以通过补办相关手续来使其合法化。例如，某些地区可能允许农户在缴纳一定费用后确认其超占部分的使用权。
- 具体来说，1982年《村镇建房用地管理条例》实施前超占的，无论面积大小，均按实际使用面积确权登记；1982年至1987年《土地管理法》实施时超占的，需在土地登记簿和权属证书中注明，待未来分户建房或房屋拆迁、改建等时按规定处理；1987年《土地管理法》实施后超占的，符合规划但超占的，补办相关用地手续后，对标准面积确权登记，超占部分在登记簿和权属证书附记栏中注明。
因人口增长或分户需求导致的超占：
- 对于符合分户条件但未获批新宅基地的农户，可以依法申请分户并重新分配宅基地。原有超占部分则需根据具体情况进行处置，如补办手续、缴纳费用或拆除等。
故意违法超占：
- 对于明知故犯的超占行为，必须依法进行拆除超出部分或采取其他强制措施。这类行为直接违反了现行法律规定，不存在合法性基础，因此必须严肃处理。
三、具体处理措施与建议
核实超占面积与原因：
- 农户应通过查阅宅基地使用证、实地测量等方式确定超占的具体范围，并结合建房时间、审批文件等查明超占的成因。这是制定处理方案的基础。
咨询当地政策与流程：
- 不同地区对超占问题的处理可能存在差异。因此，建议农户向村委会或自然资源部门了解具体的操作办法和流程，以便更好地配合整改工作。
主动配合整改工作：
- 对于需要拆除的超占部分，农户应积极配合相关部门的工作，避免引发行政纠纷。对于可保留但需缴费的情况，也应及时完成相关程序，以确保宅基地使用的合法性和合规性。
加强法律意识与规划管理：
- 农户在新建房屋前应严格履行审批程序，避免因无知导致违法。同时，应关注村庄规划动态，确保建设活动符合最新要求，从而避免未来可能出现的超占问题。
四、总结与提醒
宅基地超占面积的处理需要综合考虑多种因素，包括超占时间、原因及当地法规等。建议农户在处理此类问题时，积极与当地相关部门沟通协商，并咨询专业法律顾问或律师以获取具体法律意见和帮助。同时，也应增强法律意识，遵守土地管理和城乡规划等相关法律法规，确保宅基地使用的合法性和合规性。