在三包有效期内车辆于高速公路发生故障，赔偿问题需结合故障原因、三包条款及法律规定综合判断，具体分以下情况处理：

1. 若故障属于三包范围内的质量问题

根据《家用汽车产品修理更换退货责任规定》（以下简称“三包规定”），消费者有权要求经销商履行以下义务：

• 免费维修：经销商应承担维修费用，包括零部件更换及工时费；
• 合理补偿：若因故障导致额外损失（如拖车费、交通费、住宿费等），可依据《消费者权益保护法》要求经销商补偿。需注意保留相关票据（如高速救援发票、交通票据）作为证据；
• 特殊情形处理：若车辆在三包期内因同一质量问题累计维修超过35日，或同一问题修理超过5次仍未解决，消费者可主张换车或退车。

2. 若故障因消费者使用不当或外部因素导致

若故障由以下原因引发，经销商可能免责：

• 未按规定保养：如未按保养手册要求定期保养，或使用非指定机油、配件；
• 人为损坏：如碰撞、涉水、改装等非质量问题；
• 不可抗力：如自然灾害、战争等极端情况。

此时消费者需自行承担维修费用，但可要求经销商提供有偿救援服务（费用需协商明确）。

3. 高速公路救援的特殊规则

• 救援责任主体：根据《道路交通安全法》，高速公路救援由专业救援机构（如高速交警指定的拖车公司）负责，费用通常由消费者承担；
• 费用合理性：若救援费用明显高于市场价，可依据《价格法》向物价部门投诉；
• 经销商协助义务：经销商有义务协助联系救援，但无强制垫付费用义务（除非合同另有约定）。

4. 争议解决途径

若与经销商协商无果，可通过以下方式维权：

• 向当地市场监管部门投诉（如12315平台）；
• 申请第三方鉴定：通过省级质检机构鉴定故障原因，明确责任；
• 提起诉讼：若损失较大，可向法院起诉，主张赔偿（需准备购车合同、三包凭证、维修记录、损失票据等证据）。

建议行动步骤：

1. 立即联系经销商说明情况，要求履行三包义务；
   
2. 保留所有相关票据及沟通记录；
   
3. 若经销商推诿，向当地市场监管部门投诉或委托律师介入。
   

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体法律适用问题。