员工在年休假期间，其福利一般是不应被扣除的，这包括工资性收入和与出勤不直接挂钩的其他福利。下面我将为您详细解释这一点，并说明相关的法律依据和特殊情况。

首先，根据《职工带薪年休假条例》的规定，职工在连续工作1年以上后，有权享受带薪年休假。在年休假期间，职工应享受与正常工作期间相同的工资收入。这意味着，无论是基本工资、岗位工资还是绩效工资等固定和常规性的工资组成部分，单位都应全额支付，不得因休假而扣减。

除了基本工资外，各类奖金（如年终奖、项目奖金）以及补贴（如交通补贴、餐饮补贴、通讯补贴）等，在年休假期间也应得到正常支付。这些福利是职工基于劳动关系而非出勤情况所获得的收入，因此不应因休假而受到影响。

此外，与出勤不直接挂钩的福利，如节日礼品、生日福利等，单位同样不应因职工休年休假而扣除。这些福利是基于职工与单位的劳动关系而发放的，与出勤天数无关。

然而，也存在一些特殊情况。如果某些福利明确与出勤天数直接关联，如全勤奖，那么职工在年休假期间可能无法获得这部分福利。因为年休假不属于正常出勤状态，所以单位在这种情况下扣除全勤奖通常是合理的。

如果员工发现自己的福利在休年假期间被扣除，他们有权向单位询问原因，并要求得到合理的解释和补偿。如果单位不能给出满意的答复或拒绝纠正错误，员工可以通过申请劳动仲裁或者提起诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。

综上所述，员工在年休假期间的福利一般不应被扣除，这是由《职工带薪年休假条例》所保障的。单位应严格遵守相关法律法规，确保员工的合法权益不受侵害。同时，员工也应了解自己的权利，并在必要时采取适当措施来维护自己的权益。