在法院已进行诉前保全后，案件又在公安机关立案的情况下，法院对民事案件的立案处理需分情况讨论，具体如下：

1. 民事案件与刑事案件基于不同法律关系
   若民事案件与公安机关立案的刑事案件涉及不同法律关系（例如民事案件为合同纠纷，刑事案件为诈骗但针对不同主体或事实），法院通常不会因刑事立案而拒绝民事立案。此时需注意：

   • 民事案件的审理可能因刑事案件的侦查需要而中止（如需以刑事案件结果为前提）；
     
   • 若民事保全措施与刑事侦查冲突（如冻结资金涉及赃款），公安机关可依据《刑事诉讼法》要求法院解除保全，但需通过法定程序（如提供证据证明资金性质）。

2. 民事案件与刑事案件基于同一法律关系
   若民事案件与刑事案件涉及同一事实或法律关系（例如民事案件为借款纠纷，刑事案件为同一笔借款的诈骗），法院可能根据《最高人民法院关于在审理经济纠纷案件中涉及经济犯罪嫌疑若干问题的规定》不予受理或驳回起诉，并将材料移送公安机关。此时需注意：

   • 若民事案件已立案，法院可能裁定中止审理，待刑事案件终结后恢复；
     
   • 若诉前保全的财产与刑事案件赃款赃物重合，保全措施可能被撤销或调整。

3. 实务操作中的关键点

   • 信息沟通：法院与公安机关需通过《案件移送函》等文书互通信息，避免程序冲突；
     
   • 保全效力：诉前保全的效力原则上持续至民事案件终结，但若刑事案件优先处置财产（如追缴赃款），民事保全可能被突破；
     
   • 当事人权利救济：若法院驳回起诉或中止审理，当事人可通过刑事附带民事诉讼或另行提起民事诉讼（刑事退赔不足时）主张权利。

建议：当事人应向法院提交书面意见，说明民事案件与刑事案件的关联性，并附公安机关立案通知书等材料，以便法院综合判断立案或中止的必要性。若涉及复杂财产保全或刑民交叉问题，可进一步提供具体案情以便针对性分析。